结论前置：拆迁协议双方签字后，在特定情形下仍可能被认定为无效。这些情形主要包括主体不适格、意思表示不真实、内容违反法律法规强制性规定、恶意串通损害他人利益、代理权限问题、形式不符合法律规定以及损害社会公共利益或国家利益等。
详细分析：
主体不适格导致协议无效
- 拆迁方主体不合法：若拆迁单位未取得房屋拆迁许可证等相关资质，或未按照法定程序进行拆迁，则所签订的拆迁补偿协议无效。例如，非法定的拆迁实施主体自行与被拆迁人签订协议，该协议不具有法律效力。
- 被拆迁方主体问题：被拆迁房屋的所有权人是签订协议的适格主体。若与不具有产权的人签订协议，该协议可能无效。如房屋产权人为甲，但乙在无甲合法授权的情况下擅自签订协议，此协议在甲不追认时无效。此外，若被拆迁人为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，且未经其法定代理人或监护人同意而签订协议，该协议同样无效。
意思表示不真实导致协议无效
- 欺诈：拆迁方若故意告知虚假情况或隐瞒真实情况，诱使被拆迁人作出错误意思表示而签订协议，该协议无效。例如，虚构拆迁补偿政策以迫使被拆迁人签约。
- 胁迫：一方以给对方及其亲友的生命健康、荣誉、名誉、财产等造成损害为要挟，迫使对方违背真实意思表示而签订协议，该协议无效。如拆迁方威胁被拆迁人家人身安全以迫使其签约。
内容违反法律法规强制性规定导致协议无效
- 违反土地管理法规：若拆迁补偿协议涉及的土地使用违反了土地管理的强制性规定，如未办理农用地转用审批手续即签订协议进行建设开发，该协议无效。
- 违反城市规划法规：拆迁项目必须符合城市规划要求。若协议涉及的建设项目不符合城市总体规划、详细规划等要求，该协议无效。
- 补偿标准违法：协议中规定的补偿标准若明显低于当地政府公布的最低补偿标准，该协议因违反法律法规的强制性规定而无效。
恶意串通损害他人利益导致协议无效
拆迁方与部分被拆迁人恶意串通，通过提高这部分人的补偿标准来降低整体拆迁成本，从而损害其他被拆迁人的合法权益，这种恶意串通签订的协议无效。
代理权限问题导致协议无效
代理人若超越代理权限或无代理权时签订的拆迁补偿协议，且未经被代理人追认，该协议无效。
形式不符合法律规定导致协议可能无效
根据相关法律规定，拆迁补偿协议应当采用书面形式。若协议未采用书面形式，可能因形式要件缺失而被认定为无效。但实践中这一情形较为少见，因为大多数拆迁补偿协议都会以书面形式呈现。
损害社会公共利益或国家利益导致协议无效
拆迁补偿协议若损害社会公共利益或以合法形式掩盖非法目的，如通过虚假协议套取国家拆迁补偿款等，该协议无效。
法律建议：
- 审查拆迁方资质：在签订拆迁补偿协议前，务必审查拆迁方的资质和拆迁程序的合法性，确保拆迁方具备法定资质且按照法定程序进行拆迁。
- 核实协议内容：仔细阅读协议条款，确保协议内容合法、合规，且补偿标准不低于当地政府公布的最低补偿标准。
- 保护自身权益：若认为拆迁补偿协议存在无效情形，如欺诈、胁迫、恶意串通等，应及时收集证据并寻求法律帮助，通过法律途径维护自身合法权益。
可能法律后果：
若拆迁补偿协议被认定为无效，则协议自始不具有法律效力，双方应恢复原状或根据过错程度承担相应的赔偿责任。对于被拆迁人来说，这可能意味着需要重新协商补偿事宜或通过法律途径追讨应得的补偿。因此，在签订拆迁补偿协议时务必谨慎对待，确保协议的合法性和有效性。