关于电动自行车第二次闯红灯的处罚问题，这主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》以及当地的交通管理规定来确定。以下是我为您提供的详细解答：

一、电动自行车分类及基本处罚原则

电动自行车通常被归类为非机动车。根据《中华人民共和国道路交通安全法》第八十九条的规定，非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，将面临警告或者五元以上五十元以下的罚款。若非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚，公安机关交通管理部门还有权扣留其非机动车。

二、第二次闯红灯的具体处罚

1. 警告与罚款：

   • 对于第二次闯红灯的电动自行车驾驶人，交警通常会根据情节的严重性给予相应的处罚。如果情节相对轻微，可能会给予口头警告，并进行交通安全教育。
   • 如果情节较为严重，或者驾驶人之前已有过闯红灯的记录，那么交警很可能会处以罚款，罚款金额一般在5元至50元之间，具体金额由执法人员根据实际情况决定。

2. 扣留非机动车的可能性：

   • 如果驾驶人拒绝接受罚款处罚，或者多次闯红灯且情节严重，公安机关交通管理部门有权扣留其电动自行车作为强制措施。

三、其他可能的法律后果

1. 事故责任：

   • 若因闯红灯引发交通事故，闯红灯方通常需要承担相应的事故责任，并可能对事故导致的人身伤害、财产损失等进行赔偿。

2. 多次违法的加重处罚：

   • 如果驾驶人多次闯红灯或者情节特别严重，除了上述的罚款和扣留非机动车外，还可能面临更严厉的处罚，如行政拘留等。

3. 信用影响：

   • 多次闯红灯的记录还可能对驾驶人的个人信用产生负面影响，影响日后的某些社会活动或评估。

四、建议与提醒

1. 增强安全意识：

   • 深刻认识闯红灯的危害性，自觉遵守交通规则，确保自身和他人的安全。

2. 积极配合处理：

   • 若不慎闯红灯被查，应积极配合交警的处理，及时缴纳罚款，避免情节进一步恶化。

3. 关注当地交通管理规定：

   • 不同地区可能根据当地的交通状况出台更具体的交通管理规定，建议驾驶人关注并了解当地的相关规定，以便更好地遵守交通规则。

综上所述，电动自行车第二次闯红灯的处罚主要包括警告、罚款以及可能的扣留非机动车等措施。为了自身和他人的安全，请务必遵守交通规则，文明骑行。