结论：对于租的车由两个人开且闯了两次红灯的情况，是否可以分别处理，这主要取决于交通违法行为的记录方式以及当地交通管理部门的处理规定。一般情况下，如果两次闯红灯行为分别被记录在两个不同的驾驶人名下，那么可以分别处理；但如果记录在同一驾驶人名下，则需由该驾驶人承担全部责任。以下是对此问题的详细分析：

一、交通违法行为的记录方式

1. 电子监控记录：

   • 在大多数情况下，交通违法行为（如闯红灯）是通过电子监控设备（如摄像头）记录的。这些设备会捕捉违法行为的瞬间，并记录下车辆的车牌号码以及违法时间、地点等信息。
   • 如果电子监控设备能够清晰识别出驾驶人的面部特征，并且该特征与车辆登记信息或驾驶人信息库中的信息相匹配，那么违法行为可能会直接记录在特定驾驶人名下。

2. 现场执法记录：

   • 如果交通违法行为是由交警现场查获的，那么交警会直接记录下违法驾驶人的信息，并开具罚单。

二、分别处理的可能性

1. 不同驾驶人：

   • 如果两次闯红灯行为分别由两个不同的驾驶人实施，并且电子监控设备或交警能够清晰识别出各自的驾驶人，那么这两次违法行为可以分别处理。即，每个驾驶人只需承担自己违法行为的责任。

2. 同一驾驶人：

   • 如果两次闯红灯行为都是由同一个驾驶人实施的，无论车辆是由谁租赁或使用，该驾驶人都需要承担全部责任。在这种情况下，无法将违法行为分别处理。

三、当地交通管理部门的处理规定

• 不同地区的交通管理部门可能对于交通违法行为的处理有不同的规定。有些地区可能允许在特定条件下（如提供充分证据证明违法行为由不同驾驶人实施）对违法行为进行分别处理；而有些地区则可能严格执行“一车一责”的原则，即无论违法行为由多少驾驶人实施，都由车辆的使用人或所有人承担责任。

四、法律建议

1. 了解当地规定：

   • 在处理此类问题时，首先应了解当地交通管理部门对于交通违法行为处理的具体规定。这可以通过查阅相关法律法规、咨询交通管理部门或寻求专业律师的帮助来实现。

2. 收集证据：

   • 如果认为两次闯红灯行为应分别处理，应尽可能收集证据证明违法行为由不同驾驶人实施。这可以包括电子监控设备的拍摄画面、交警的现场执法记录、目击者的证言等。

3. 积极配合处理：

   • 无论最终如何处理，都应积极配合交通管理部门的工作，按照要求接受处罚或提供相关证据。避免逃避责任或采取不正当手段干扰处理过程。

最后，如果您在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。