刑事案件能否“消除”（即撤销或实质上终止处理），取决于案件所处的诉讼阶段、已查明的事实以及法律规定。以下从不同阶段为你详细解析：
一、立案侦查阶段
公安机关主动撤销：
- 在侦查过程中，如果公安机关发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，如犯罪嫌疑人死亡、情节显著轻微危害不大不认为是犯罪、犯罪已过追诉时效期限等法定情形，应当撤销案件。例如，经调查发现犯罪事实并非该嫌疑人所为，或者证据不足以证明嫌疑人有犯罪事实等。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百六十三条规定，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。
检察机关监督撤销：
- 如果检察机关在审查批捕或审查起诉阶段发现公安机关立案不当，如案件不符合立案条件，或者存在违法立案等情况，可以要求公安机关撤销案件。
- 法律依据：《人民检察院刑事诉讼规则》等相关规定赋予了检察机关对公安机关立案活动的监督权。
二、审查起诉阶段
法定不起诉（相对意义上的“撤销”）：
- 对于情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的等情形，检察院会作出法定不起诉决定，从某种程度上可视为对该案件的“撤销”。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第一款规定，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
酌定不起诉（相对意义上的“撤销”）：
- 对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，检察院可以作出酌定不起诉决定。这虽然不是严格意义上的撤销案件，但结果是不再对犯罪嫌疑人提起公诉，类似于案件被终止处理。
- 例如：某些初犯、偶犯，犯罪情节较轻，有悔罪表现，积极赔偿被害人损失并取得谅解等情况。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第二款规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
证据不足不起诉（相对意义上的“撤销”）：
- 经过补充侦查后，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，会作出证据不足不起诉决定。这也使得案件不会进入审判程序，相当于在一定程度上“撤销”了对犯罪嫌疑人的指控。
- 例如：在一些复杂的经济犯罪案件中，由于证据收集困难等原因，导致关键证据缺失，无法形成完整的证据链。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条第四款规定，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。
三、审判阶段
终止审理（类似撤销的效果）：
- 在审判过程中，如果出现被告人死亡、自诉人撤诉等特殊情形，法院会裁定终止审理。这种情况下，案件不会再继续进行审判程序，与撤销案件有一定的相似效果。
- 例如：在审理一起故意伤害案件时，被告人在开庭前突然死亡，法院就会裁定终止审理。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百零六条规定，在审判过程中，有下列情形之一，致使案件在较长时间内无法继续审理的，可以中止审理：（一）被告人患有严重疾病，无法出庭的；（二）被告人脱逃的；（三）自诉人患有严重疾病，无法出庭，未委托诉讼代理人出庭的；（四）由于不能抗拒的原因。中止审理的原因消失后，应当恢复审理。中止审理的期间不计入审理期限。同时，对于被告人死亡的情形，根据相关司法解释和司法实践，会裁定终止审理。
宣告无罪（实质否定指控）：
- 如果经过法庭审理，法院认为被告人不构成犯罪，会判决宣告被告人无罪。这虽然不是传统意义上的撤销案件，但从结果上看，是对之前指控的全面否定，使被告人摆脱了犯罪嫌疑。
- 例如：在一起诈骗案件中，法院经审理认为公诉机关指控的证据不足以证明被告人有诈骗的主观故意和行为，最终判决被告人无罪。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百条规定，在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：（一）案件事实清楚，证据确实、充分，依据法律认定被告人有罪的，应当作出有罪判决；（二）依据法律认定被告人无罪的，应当作出无罪判决；（三）证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
总结与建议：
刑事案件的“消除”并非简单的过程，而是需要依据案件所处的阶段、已查明的事实以及法律规定来综合判断。如果你或你身边的人涉及刑事案件，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解案件走向和可能的结果。我是杨勇律师，专注于刑事辩护领域，如果你有任何法律问题，可以直接向我咨询。