结论：掩隐罪初犯涉及10万流水且获利3000元的情况下，是否不起诉并非绝对，需结合具体案情、证据情况以及司法机关的裁量来综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、法律条款与不起诉条件
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，不起诉主要分为法定不起诉、酌定不起诉和证据不足不起诉三种情形。对于掩隐罪（即掩饰、隐瞒犯罪所得、犯罪所得收益罪）的初犯，若要争取不起诉，通常需考虑酌定不起诉的情形，即犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
二、案情与证据分析
犯罪情节：
- 流水金额10万且获利3000元，这一数额虽不构成特别巨大，但已达到掩隐罪的立案标准。然而，是否构成“情节轻微”需结合具体案情，如是否多次作案、是否具有自首、立功等情节。
- 若行为人系初犯，且犯罪动机并非出于恶意或贪婪，而是由于法律意识淡薄或一时贪念，这可能在一定程度上减轻其犯罪情节。
证据情况：
- 证据的充分性和确凿性是决定是否起诉的关键因素。若证据存在瑕疵或不足以证明行为人的犯罪事实，司法机关可能会作出不起诉决定。
- 行为人及其辩护律师应积极收集有利于自己的证据，如证明自己不知情、未参与或受他人胁迫等。
三、司法机关的裁量
检察机关的审查：
- 检察机关在审查起诉阶段会对案件进行全面审查，包括犯罪事实、证据情况、犯罪情节以及行为人的社会危害性等。
- 若检察机关认为行为人犯罪情节轻微，且符合不起诉的条件，可能会作出不起诉决定。
法院的审判：
- 即使案件进入审判阶段，法院也会根据案件的具体情况，结合行为人的犯罪情节、社会危害性以及悔罪表现等因素，作出是否判处刑罚的判决。
- 若法院认为行为人符合免除刑罚的条件，可能会作出无罪判决或免予刑事处罚的判决。
四、建议与策略
积极配合调查：
- 行为人应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，提供有利于自己的证据。
寻求专业法律帮助：
- 行为人及其家属应尽快咨询专业律师，了解案件的具体情况，制定合适的辩护策略。
- 律师可以帮助行为人分析案情，收集证据，提出不起诉或减轻处罚的辩护意见。
关注悔罪表现：
- 行为人应表现出真诚的悔罪态度，积极退赃退赔，争取取得被害人的谅解。
- 悔罪表现是司法机关在裁量时考虑的重要因素之一。
总结：掩隐罪初犯涉及10万流水且获利3000元的情况下，是否不起诉需结合具体案情、证据情况以及司法机关的裁量来综合判断。行为人应积极配合调查，寻求专业法律帮助，并关注自己的悔罪表现，以争取最有利的结果。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。