结论：违法用地状态消除后，违法行为人仍然可能面临查处和处罚。以下是对此问题的详细分析：
违法行为已发生，处罚依据明确
- 行政处罚针对的是已经发生的违法行为。一旦当事人实施了违反土地管理法律法规的行为，如未经批准擅自占用土地、非法转让土地使用权等，这些行为就构成了违法事实。
- 即便之后通过自行拆除违法建筑、退还非法占用的土地等方式消除了违法状态，也不能改变违法行为已经发生且产生后果的事实。
- 法律依据：《中华人民共和国土地管理法》及《中华人民共和国土地管理法实施条例》等相关法律法规中，对各类土地违法行为都明确规定了相应的处罚措施，并未将消除违法状态作为免除处罚的条件。例如，《土地管理法》第七十七条明确规定了非法占用土地的处罚措施，包括责令退还非法占用的土地、限期拆除或没收建筑物、罚款等。
处罚旨在惩戒与教育
- 对土地违法行为进行处罚，不仅是为了纠正具体的违法行为，更重要的是通过惩戒违法行为人，起到教育和警示社会的作用，防止类似违法行为再次发生。
- 如果仅仅因为违法状态被消除就免除处罚，那么法律的威严和公正性将受到严重挑战，也可能导致更多人抱有侥幸心理，认为只要事后消除违法状态就能逃避法律责任。
从轻或减轻处罚的情形
- 尽管消除违法状态并不能完全免除处罚，但在某些情况下，它可能会对处罚结果产生影响。
- 执法部门在决定处罚时，会综合考虑违法行为的具体情况和当事人的态度等因素。如果违法行为人在土地管理部门发现之前，就主动采取措施消除违法状态，有效避免或减少了土地资源的破坏和损失，并且积极配合调查工作，如实提供相关资料和情况，那么执法部门可能会根据具体情况从轻或者减轻处罚。
- 法律依据：《中华人民共和国行政处罚法》规定，当事人主动消除或者减轻违法行为危害后果的，应当从轻或者减轻行政处罚。
实际案例与法律后果
- 以某企业未经批准占用少量土地建设临时仓库为例，如果该企业在意识到违法后立即自行拆除仓库，恢复土地原状，并且未对土地造成实质性破坏，同时积极配合调查，那么土地管理部门在进行处罚时就可能会考虑从轻处罚。
- 然而，如果违法行为人未主动消除违法状态，或者对土地造成了严重破坏，那么将面临更严厉的处罚，包括高额罚款、没收建筑物等。
建议：
- 在使用和管理土地时，一定要严格遵守相关的法律法规，避免产生任何违法行为。
- 如果一旦不小心违反了规定，也应该及时采取措施消除违法状态，并主动接受相关部门的调查和处理，以争取更好的处理结果。
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