结论：被纪检委留置三年若最终没有证据证明有违法犯罪行为，一般情况下是可以申请国家赔偿的，但具体能否获得赔偿还需根据实际情况判断。

分析说明：

1. 留置的性质与目的：

   • 留置是纪检监察机关对涉嫌严重违纪违法的公职人员采取的一种限制人身自由的调查措施，其目的是为了深入调查取证，查明事实真相。
   • 留置并非刑事处罚，而是一种调查手段，因此留置期间并不等同于服刑期间。

2. 国家赔偿的适用条件：

   • 根据《中华人民共和国国家赔偿法》的相关规定，国家赔偿主要适用于行政机关及其工作人员在行使职权时侵犯公民、法人和其他组织合法权益的情形。
   • 在纪检监察留置案件中，如果最终没有证据证明被留置人员有违法犯罪行为，且留置措施给被留置人员造成了人身自由等合法权益的损害，那么被留置人员有权申请国家赔偿。

3. 留置三年的特殊情况：

   • 留置期限一般不得超过三个月，在特殊情况下，可以延长一次，延长时间不得超过三个月。因此，留置三年显然超出了法定留置期限。
   • 如果留置三年最终没有证据证明有违法犯罪行为，这很可能意味着留置措施存在不当或违法情形，从而增加了申请国家赔偿的成功率。

4. 申请国家赔偿的程序与注意事项：

   • 被留置人员或其家属应在知道或应当知道国家机关及其工作人员行使职权时的行为侵犯其人身权、财产权之日起两年内，向赔偿义务机关提出赔偿申请。
   • 赔偿申请应书面提出，并载明受害人的基本情况、赔偿请求及事实和理由、赔偿义务机关等事项。
   • 赔偿义务机关应在收到申请之日起两个月内作出赔偿决定。如果赔偿义务机关拒绝赔偿或未在规定期限内作出赔偿决定，被留置人员或其家属可以向其上一级机关申请复议，或直接向人民法院提起诉讼。

行动建议：

• 如果您或您身边的人遭遇了类似情况，即被纪检委留置多年且最终没有证据证明有违法犯罪行为，建议尽快咨询专业律师（即我本人，王永刚律师，专注于交通事故、合同纠纷、民间借贷、婚姻家庭、行政诉讼、国家赔偿、行政复议领域），了解具体的申请国家赔偿流程和所需材料。
• 在申请国家赔偿过程中，务必保留好所有相关证据和文件，如留置通知书、解除留置通知书、无罪证明等，以便在申请过程中提供有力支持。
• 同时，也要注意申请国家赔偿的时效性，确保在规定期限内提出申请。