核心结论：征用协议书只写青苗补偿而未写征地补偿款，可能存在以下几种情况，下面为你详细分析。
协议内容不完整或存在疏漏
- 可能原因：在拟定征用协议书时，相关工作人员可能由于疏忽或者对协议条款设置不够严谨，遗漏了征地补偿款这一重要内容。比如，在整理补偿项目清单时，只关注到了青苗这一直观的补偿对象，而忽略了土地本身的价值补偿。
- 后果：这可能导致被征用方的权益受损，因为征地补偿款是对土地被征用这一核心事项的补偿，缺失这一条款会使被征用方无法获得应有的经济补偿。
- 建议：如果发现协议存在此类问题，被征用方应及时与征用方沟通，要求补充征地补偿款的相关条款，明确补偿标准、支付方式和支付时间等内容，以确保自身权益得到保障。
征用性质或用途的特殊限制
- 可能原因：某些特定的征用项目可能基于其性质或用途，在补偿方面有特殊规定。例如，如果是临时征用土地用于短期建设项目，可能只对青苗等地上附着物进行补偿，而不涉及土地本身的长期征用补偿，即不支付征地补偿款。
- 后果：被征用方需要了解这种特殊规定是否合理合法。如果征用方的做法符合相关法律法规和政策要求，那么被征用方可能需要接受这种补偿方式；但如果征用方以不合理的理由不支付征地补偿款，则可能侵犯了被征用方的合法权益。
- 建议：被征用方应仔细研究征用项目的相关政策文件和法律法规，判断征用方的行为是否合法。如有疑问，可向我进一步咨询，我会结合具体法律法规为你分析。
双方对补偿范围的理解存在差异
- 可能原因：在协商征用补偿事宜时，征用方和被征用方可能对补偿范围的理解不一致。征用方可能认为青苗补偿已经涵盖了主要的补偿内容，而忽略了被征用方对土地本身价值的期望；或者被征用方在签订协议时没有充分表达自己对征地补偿款的需求。
- 后果：这种理解差异可能导致后续的纠纷和矛盾。被征用方可能在协议签订后发现自己的权益没有得到充分保障，从而要求征用方追加补偿，而征用方可能认为已经按照协议履行了义务，拒绝追加补偿。
- 建议：为了避免这种情况的发生，双方在签订协议前应充分沟通，明确各自的诉求和期望，确保协议内容能够准确反映双方的意愿。如果已经签订了协议才发现存在理解差异，双方应再次协商，寻求妥善的解决方案。