非法经营行政处罚的管辖部门主要依据违法行为发生地、行政机关级别、职能范围以及特定规定来确定。以下从不同角度为您详细分析：
地域管辖原则
- 非法经营行为的行政处罚通常由违法行为发生地的行政机关管辖。这一原则有助于及时发现和查处违法行为，便于调查取证和日常监管。例如，若某商家在A市非法销售未经批准的药品，那么A市的相关行政机关（如市场监管部门）就具有管辖权。
级别管辖与特殊规定
- 一般原则：行政处罚一般由县级以上地方人民政府具有行政处罚权的行政机关管辖。这是因为县级以上行政机关具备相应的执法能力和资源，能有效实施行政处罚。
- 特殊规定：对于非法经营行为，若法律、行政法规或规章有特别规定，则按照这些特殊规定执行。例如，在烟草专卖领域，非法经营烟草制品的行为可能由烟草专卖行政主管部门管辖；在金融领域，非法经营金融业务的行为可能由金融监管部门（如中国人民银行、银保监会等）管辖。
职能管辖
- 非法经营行为的行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。不同行政机关依据法律、法规规定，负责各自领域的行政处罚工作。例如：
- 市场监管部门：负责查处市场交易、竞争、质量、广告、价格等方面的非法经营行为，如销售假冒伪劣商品、虚假宣传、哄抬物价等。
- 商务部门：可能负责查处与对外贸易、特许经营等相关的非法经营行为。
- 其他专门部门：如烟草专卖、金融监管、药品监管等部门，分别负责各自领域的非法经营行为的查处。
指定管辖与移送管辖
- 指定管辖：当两个以上行政机关对同一非法经营行为都有管辖权时，由最先立案的行政机关管辖。若发生管辖争议，应首先协商解决；协商不成，则报请共同的上一级行政机关指定管辖，或直接由共同的上一级行政机关指定管辖。
- 移送管辖：若非法经营行为涉嫌犯罪，行政机关应及时将案件移送司法机关追究刑事责任。对于依法不需要追究刑事责任或免予刑事处罚，但应给予行政处罚的案件，司法机关应及时将案件移送有关行政机关处理。
实际案例与法律建议：
- 假设某商家在未取得食品经营许可证的情况下，擅自销售食品，被市场监管部门查处。在此情况下，市场监管部门作为违法行为发生地的具有行政处罚权的行政机关，将依法对商家进行行政处罚，包括责令停止违法行为、没收违法所得和非法财物、罚款等。
- 若您或您身边的人遇到非法经营行政处罚相关的问题，建议首先了解清楚违法行为的具体性质、发生地以及可能的管辖部门。同时，务必确保自身的经营活动合法合规，避免触犯法律。
总结与提醒：
- 非法经营行为的行政处罚管辖部门需综合考虑地域、级别、职能及特殊规定等多个因素来确定。
- 不同领域的非法经营行为可能由不同的行政机关管辖，因此在实际操作中需具体问题具体分析。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。