婚内财产协议的电子版在符合一定条件下是有效的，但建议尽快补办或采取其他补救措施以确保其法律效力最大化。具体分析如下：

1. 电子版的法律效力基础
   根据《民法典》第四百六十九条，书面形式包括合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式，以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。因此，若婚内财产协议的电子版（如扫描件、PDF等）能清晰还原原件内容，且双方均认可其真实性，则具有法律效力。

2. 电子版有效的核心条件

   • 内容完整性：电子版需与原件内容完全一致，无篡改或缺失。
     
   • 双方认可：双方均需承认电子版与原件具有同等效力（可通过补充签字、录音录像等方式确认）。
     
   • 可证明性：需能证明电子版来源于原件（如扫描时间、设备记录等），且未被后续修改。
     
   • 不违反强制性规定：协议内容需合法，且未涉及需公证或登记的财产（如房产过户需以登记为准）。

3. 原件丢失的风险与补救

   • 风险：若发生纠纷，对方可能质疑电子版的真实性（如主张篡改），此时需提供其他证据佐证（如协议签订时的沟通记录、见证人证言等）。
     
   • 补救措施：
     
     • 重新签订：双方可协商重新签订一份协议，并注明“原协议丢失，以此份为准”。
       
     • 公证或见证：对电子版进行公证，或邀请第三方见证并签字确认。
       
     • 补充证据：收集与协议相关的其他证据（如履行协议的转账记录、财产管理记录等），形成证据链。

4. 特殊情形处理

   • 涉及不动产：若协议涉及房产等需登记的财产，即使有电子版协议，仍需办理过户或变更登记手续，否则可能面临“物权未变动”的风险。
     
   • 对方不认可：若对方否认电子版效力，需通过诉讼解决，此时法院会综合证据判断（如双方履行情况、交易习惯等）。

建议：

• 立即与对方沟通，确认电子版的效力，并补充签字或公证；
  
• 整理与协议相关的其他证据，以备不时之需；
  
• 若涉及重要财产，可咨询我进一步评估风险并制定方案。