被告在面对原告以物权纠纷起诉不配合签名领新房证的情况时，可以从以下几个角度进行应诉：
核实原告的诉讼请求及事实依据
- 首先，被告需要仔细阅读原告的起诉状，明确原告的具体诉讼请求是什么，比如是要求被告配合签名领取新房证，还是在此基础上要求赔偿因不配合导致的损失等。
- 接着，核实原告所陈述的事实是否真实存在，比如双方是否有关于新房证领取的约定，被告不配合签名是否有合理理由等。
分析不配合签名的原因及合法性
- 被告应深入分析自己不配合签名的原因，比如是否因为对新房的产权归属有争议，或者认为领取新房证的条件尚未成就等。
- 如果被告不配合签名有合法理由，比如原告存在违约行为导致新房证领取条件不成就，或者双方对新房产权有争议且尚未解决，那么被告可以在应诉时提出这些抗辩理由。
准备相关证据材料
- 被告需要收集并整理与案件相关的证据材料，比如双方关于新房证领取的约定、被告不配合签名的具体原因及证据、新房产权归属的相关证据等。
- 这些证据材料将用于支持被告的抗辩理由，证明被告不配合签名并非无理取闹，而是有合法依据的。
考虑反诉或提出其他诉讼请求
- 如果被告认为原告在案件中存在过错或违约行为，且给自己造成了损失，那么被告可以考虑在应诉时提出反诉，要求原告承担相应的赔偿责任。
- 或者，如果被告认为新房产权归属存在争议，且该争议与本案紧密相关，那么被告也可以提出确认新房产权归属的诉讼请求。
寻求专业法律帮助
- 鉴于物权纠纷案件的复杂性和专业性，被告在应诉前最好咨询专业律师的意见，了解自己的权利和义务，以及案件的可能走向和应对策略。
- 律师将根据被告的具体情况，提供针对性的法律建议和帮助，确保被告在应诉过程中能够充分维护自己的合法权益。
在应诉过程中，被告还需要注意以下几点：
- 遵守诉讼程序：被告应按照法院的要求，按时提交答辩状和相关证据材料，参加庭审等诉讼活动。
- 保持冷静理性：在诉讼过程中，被告应保持冷静理性，避免情绪化行为或言论，以免对案件处理产生不利影响。
- 积极沟通协商：如果可能的话，被告可以尝试与原告进行沟通协商，寻求和解或调解的可能性，以降低诉讼成本和时间成本。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，被告在应诉时应根据自己的实际情况和案件的具体情况来制定应对策略。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。