结论：汽车使用性质登记为租赁性质，但实际用于跑网约车，这一行为是否合法，需结合具体情况来判断，若车辆及驾驶员均符合网约车运营的相关规定，则合法；反之，则可能面临法律风险。以下从多个角度进行详细分析：
一、网约车运营的合法性要求
车辆要求：
- 根据《网络预约出租汽车经营服务管理暂行办法》等相关规定，网约车车辆需满足一定的条件，如车辆性质需变更为“预约出租客运”，并取得相应的网约车运输证。
- 若车辆使用性质仍登记为租赁性质，而未变更为预约出租客运，则可能不符合网约车运营的车辆要求。
驾驶员要求：
- 网约车驾驶员需取得相应的网约车驾驶员证，并满足一定的年龄、驾龄、无犯罪记录等条件。
- 若驾驶员未取得网约车驾驶员证，或不符合其他相关条件，则从事网约车运营可能构成非法营运。
二、租赁性质车辆用于网约车的法律风险
合同风险：
- 若车辆租赁合同中明确约定了车辆的使用目的和范围，且禁止将车辆用于网约车运营，则驾驶员擅自改变车辆使用性质可能构成违约，需承担相应的违约责任。
行政处罚风险：
- 根据相关法律法规，未经许可擅自从事网约车运营的，可能面临交通管理部门的行政处罚，如罚款、扣车等。
- 若车辆使用性质未变更为预约出租客运，而用于网约车运营，还可能因车辆性质不符而面临额外的处罚。
保险风险：
- 租赁性质车辆的保险通常覆盖的是租赁期间的风险，若车辆用于网约车运营，可能因使用性质改变而导致保险失效或保险赔付受限。
- 在发生交通事故时，若保险公司发现车辆使用性质与保险合同不符，可能拒绝赔付或减少赔付金额。
三、合法运营的建议
变更车辆性质：
- 若计划将租赁性质车辆用于网约车运营，建议先向相关部门申请变更车辆性质为预约出租客运，并取得网约车运输证。
取得驾驶员证：
- 驾驶员需取得相应的网约车驾驶员证，并满足其他相关条件，以确保合法运营。
审查租赁合同：
- 在租赁车辆前，应仔细审查租赁合同中的条款，确保合同允许将车辆用于网约车运营，或与出租方协商修改合同条款。
购买适当保险：
- 为车辆购买适合网约车运营的保险，以确保在发生交通事故时能够得到充分的赔付。
总结与建议：汽车使用性质登记为租赁性质，但实际用于跑网约车，这一行为是否合法需结合车辆及驾驶员是否符合网约车运营的相关规定来判断。为确保合法运营并降低法律风险，建议变更车辆性质、取得驾驶员证、审查租赁合同并购买适当保险。若您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我会为您提供专业的法律帮助。