若公司内部处罚且程序合法合规，员工一般需接受处罚；若处罚缺乏依据或程序违法，可通过协商、投诉或法律途径维权。以下从不同情况展开分析：
一、公司处罚的合法性判断
- 处罚依据：公司对员工进行罚款，必须有明确的规章制度依据，且该制度需符合《劳动合同法》第四条的规定，即经过民主程序制定（如职工代表大会讨论）、向员工公示或告知。若公司没有合法有效的制度依据，罚款行为可能被认定为违法。
- 处罚程序：即使公司有合法的处罚制度，也需按照规定的程序进行处罚，如告知员工违规事实、听取员工陈述申辩、作出书面处罚决定等。若程序违法，员工有权拒绝接受处罚。
- 处罚金额：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因员工本人原因给公司造成经济损失的，公司可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准。若公司罚款金额超过此限制，可能被认定为违法。
二、过期药下架后的责任认定
- 员工责任：若过期药下架是由于员工个人疏忽或违规操作导致（如未及时检查库存、未按规定处理过期药品等），公司可能依据内部制度对员工进行处罚。但处罚需符合上述合法性要求。
- 公司责任：若过期药下架是由于公司管理不善（如采购环节失控、库存管理系统漏洞等）或不可抗力因素导致，且员工无过错，公司无权对员工进行处罚。
三、应对建议
- 核实处罚依据和程序：要求公司出示相关规章制度和处罚决定书，核实处罚是否有依据、程序是否合法。
- 与公司协商：若认为处罚不合理或违法，可与公司协商解决，要求撤销或减轻处罚。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求介入调查并维护自身权益。
- 申请劳动仲裁：若投诉未果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求确认公司处罚行为违法并赔偿损失。