农民基本农田被征收时，补偿费的归属问题需根据补偿费用的具体类型来确定，具体如下：
土地补偿费：
- 归属：土地补偿费归农村集体经济组织所有。这是因为农村集体土地的所有权属于农村集体经济组织，土地被征收后，土地补偿费用于弥补因土地被征收而给集体经济组织造成的损失。
- 分配：农村集体经济组织在收到土地补偿费后，应依照法律规定的民主议定程序，决定在本集体经济组织内部分配方案。通常，这部分费用会考虑农民的承包面积、承包期限、投入情况等因素，确保农民得到合理的补偿。在实践中，大部分地区会将一定比例（如70%-80%）的土地补偿费分配给被征地农户。
安置补助费：
- 归属与分配：安置补助费主要用于安置因土地被征收而失去土地的农民。
- 如果由农村集体经济组织负责安置，则安置补助费支付给农村集体经济组织，用于提供就业培训、开辟新项目等安置措施。
- 如果由其他单位进行安置，则安置补助费支付给安置单位，用于岗位培训、工资发放等。
- 如果不需要统一安置，安置补助费则发放给被安置人员个人，或者征得被安置人员同意后用于支付其保险费用。
地上附着物和青苗的补偿费：
- 归属：地上附着物（如房屋、树木等）和青苗（如农作物）的补偿费归其所有者所有。这是因为这些附着物和青苗是农民个人的财产，土地被征收时，其补偿费应当归农民个人所有。
- 分配：直接支付给相关的所有权人或使用权人，如农户种植的农作物、搭建的蔬菜大棚等对应的补偿费。
特殊情况下的补偿归属：
- 承包地被征收：如果承包地被依法征收，承包方（即农民）有权获得相应的补偿。这包括土地补偿费的一部分（具体比例由法律规定或双方约定）、地上附着物和青苗的补偿费等。承包方还可以要求发包方给付已经收到的地上附着物和青苗的补偿费。
- 土地流转后被征收：在土地流转的情况下，如果流转的土地被征收，补偿费的分配需要依据流转合同的约定来确定。一般来说，土地补偿费可能归农村集体经济组织所有，但流转合同另有约定的除外；地上附着物和青苗的补偿费则通常归实际投入人所有。
法律建议：
- 农民在面临基本农田被征收时，应了解自己的权益和义务，积极参与土地补偿费的分配过程。
- 如果认为自己的合法权益受到侵害，可以通过合法途径向相关部门反映和诉求，如向村民委员会、乡镇政府或县级以上土地管理部门提出异议或申请调解。
- 在土地补偿费分配过程中，若产生争议，应首先通过协商、调解等方式解决。协商、调解不成的，可以依法申请仲裁或提起诉讼，以维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国土地管理法》第四十八条明确规定了征收土地时的补偿内容和标准，包括土地补偿费、安置补助费以及农村村民住宅、其他地上附着物和青苗等的补偿费用。
- 其他相关法律法规，如《农村土地承包法》等，也对土地征收补偿问题有所涉及，为农民提供了法律保障。
希望以上解答能够帮助您更好地理解农民基本农田被征收时补偿费的归属问题。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。