结论前置：有建设许可证并不一定就不算违建，判断一个建筑是否属于违建，需综合考虑建设许可证的合法性、有效性及其具体内容，同时结合当地法律法规与建筑的实际建设情况。以下是对此问题的详细分析：

一、合法有效的建设许可证与合规建设

建设许可证是政府相关部门依据法律法规和城乡规划，对申请人的建设资格、条件及方案审查后颁发的合法凭证。当建设人严格按照许可证规定的建设位置、层数、面积、用途等内容进行建设时，所建建筑为合法建筑，不属于违建。这要求建设活动必须完全符合许可证的所有条款，且遵循当地的城乡规划和土地使用规划。

举例说明：假设某人获得了一份建设许可证，允许其在某地块上建设一栋两层的住宅，且明确了建筑面积和用途。如果该人严格按照许可证的规定进行建设，那么所建住宅就是合法的，不属于违建。

二、可能导致被认定为违建的情况

1. 未按许可内容建设：

   • 任何超出或违反建设许可证规定的建设行为，如擅自改变建筑位置、超建面积或层数、改变房屋用途等，均可能使该部分建筑被认定为违建。

2. 许可证不合法或失效：

   • 不合法：若建设许可证是通过欺骗、贿赂等不正当手段取得，则该许可证无效，基于其建设的建筑也可能被视为违建。
   • 失效：建设许可证具有有效期限制。若超过有效期才开始建设，或建设周期过长且未依法办理延期手续，此时的建设行为及所建建筑可能构成违法。

3. 违反其他相关法律法规：

   • 即使持有建设许可证，若建设过程破坏了生态环境、影响了历史文化遗迹保护等，违反了除城乡规划、土地使用规划外的其他法律法规，也可能导致建筑被认定为违建。例如，在具有历史文化价值的街区内，建筑需符合该区域的历史风貌保护要求，否则可能被视为违建。

4. 许可证被撤销或注销后的继续建设：

   • 若建设许可证因某种原因被撤销或注销，而建设活动仍在进行或已建成的建筑未拆除，此类建设行为同样可能被视为违法。

三、综合判断与建议

判断建筑是否违建是一个复杂的法律问题，需综合考虑建设许可证的内容、当地法律法规以及建筑的实际建设情况。对于任何关于建筑合法性的疑问，我建议：

1. 仔细审查建设许可证：确保许可证是合法有效的，且完全符合你的建设需求。
2. 咨询当地相关部门：在建设前，咨询当地的城乡规划部门或土地管理部门，了解具体的法律法规和审批流程。
3. 聘请专业法律顾问：如果涉及复杂的法律问题或存在争议，聘请专业的法律顾问进行法律咨询，以获取准确、专业的法律意见和指导。

举例说明：如果你计划在某地块上建设一栋商业建筑，但只获得了住宅的建设许可证，那么即使你开始建设，该建筑也可能因违反许可证规定的用途而被认定为违建。因此，在建设前务必确保所有手续齐全且符合规定。

综上所述，持有合法有效的建设许可证并不直接等同于所建建筑一定合法。遵守许可证的具体规定、确保许可证的有效性以及遵循所有相关法律法规是避免建筑被认定为违建的关键。如果你有任何关于建筑合法性的疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。