结论：在交房后已过保质期发现玻璃上密密麻麻的珍珠漆问题，责任承担需视具体情况而定，可能涉及开发商、施工单位或业主自身。以下从不同角度进行分析：
一、从房屋质量保修责任角度分析
保修期内责任：
- 若在保修期内发现此类问题，根据《商品房销售管理办法》等相关规定，开发商应承担保修责任。但本案例中已过保质期，此点不直接适用，但可作为理解保修责任的基础。
保修期外责任：
- 保修期外，开发商通常不再承担保修责任。然而，如果问题是由于开发商或施工单位在保修期内未履行保修义务，或者问题本身是由于施工缺陷导致的，且该缺陷在保修期内即已存在但未被发现，业主可能仍有权要求开发商或施工单位承担责任。但这种情况需要业主提供充分证据证明。
二、从合同角度分析
购房合同条款：
- 业主应首先审查购房合同中关于房屋质量、保修期限及保修责任的条款。如果合同中有明确约定，如“房屋交付后一定期限内，开发商负责维修因施工原因造成的质量问题”，则业主可依据合同条款要求开发商承担责任。
合同无明确约定：
- 若合同无明确约定，则需依据相关法律法规及行业惯例来判断。在此情况下，业主可能需要通过法律途径来明确责任归属。
三、从实际损害及因果关系角度分析
实际损害：
- 业主需证明玻璃上的珍珠漆问题对其造成了实际损害，如影响了房屋的正常使用、降低了房屋价值等。
因果关系：
- 业主还需证明该问题是由开发商或施工单位的过错导致的，即存在因果关系。这可能需要专业的鉴定机构进行鉴定。
四、建议行动
收集证据：
- 业主应收集相关证据，如购房合同、房屋交付时的验收记录、问题照片或视频、专业鉴定报告等，以证明问题的存在及责任归属。
与开发商或施工单位协商：
- 在收集到充分证据后，业主可尝试与开发商或施工单位进行协商，寻求解决方案。
法律途径：
- 若协商无果，业主可考虑通过法律途径来维护自己的权益，如向法院提起诉讼或向相关行政部门投诉。
总结与启示：在处理此类问题时，业主应首先明确保修期限及合同条款，收集充分证据，并尝试与开发商或施工单位协商解决。若协商无果，可寻求法律途径来维护自己的权益。同时，也提醒业主在购房时应仔细审查合同条款，了解房屋质量保修责任及期限，以便在出现问题时能够及时维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。