在房屋租赁合同纠纷中，关于仲裁部门的选择，主要依据当事人之间的仲裁协议来确定。以下是详细解答：

1. 有约定仲裁条款的情况：

   • 如果房屋租赁合同中明确约定了仲裁条款，且该约定符合法律规定（即选定了明确的仲裁委员会，且仲裁事项属于仲裁范围），那么发生纠纷时，应向双方约定的仲裁机构申请仲裁。例如，合同中若约定“因本合同引起的任何争议，均提交XX仲裁委员会仲裁”，则应按此执行。
   • 仲裁协议应包含请求仲裁的意思表示、明确的仲裁事项以及选定的仲裁委员会等内容，这是仲裁的前提条件。

2. 未约定或约定不明确的情况：

   • 若合同中没有约定仲裁条款，或约定不明确（如未选定具体的仲裁委员会、仲裁事项超出范围等），则当事人不能通过仲裁方式解决纠纷，而应选择向房屋所在地的人民法院提起诉讼来解决纠纷。
   • 在这种情况下，如果双方当事人希望采用仲裁方式解决纠纷，可以在纠纷发生后达成补充协议，明确约定将纠纷提交某一仲裁机构仲裁，且该约定需有效。

3. 仲裁流程与注意事项：

   • 申请仲裁：申请人需向约定的仲裁机构提交仲裁申请书及相关证据材料，明确提出仲裁请求和事实、理由。
   • 受理：仲裁机构收到申请后，会对申请进行审查。符合受理条件的，予以受理并通知被申请人。
   • 组成仲裁庭：根据案件情况，仲裁机构会组成仲裁庭，通常由三名仲裁员或一名仲裁员组成。
   • 审理和裁决：仲裁庭按法定程序进行审理，包括开庭、质证、辩论等环节，并在查明事实的基础上作出裁决。仲裁裁决一般具有终局性，对双方当事人产生法律约束力。

4. 诉讼的选择：

   • 当合同未约定仲裁条款或约定不明确时，当事人有权选择向房屋所在地的人民法院提起诉讼来解决纠纷。诉讼程序可能包括一审、二审等救济途径，与仲裁的终局性有所不同。

建议：

• 在签订房屋租赁合同时，建议双方认真考虑是否选择仲裁作为纠纷解决方式，并明确约定相关条款（包括选定的仲裁委员会、仲裁事项等）。同时，应确保仲裁协议的合法性和有效性，以避免后续可能出现的纠纷解决难题。
• 如果在合同履行过程中发生纠纷，且合同中有明确的仲裁条款，那么应按照合同约定向约定的仲裁机构申请仲裁。如果没有仲裁条款或约定不明确，则可以选择向房屋所在地的人民法院提起诉讼。

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