农商贷款逾期一天是否会再自动扣款，需分情况讨论：

1. 贷款合同中有明确约定自动扣款条款
   若贷款合同中明确约定了“逾期后仍会按约定时间自动扣款”（包括逾期后的次日），则银行有权在逾期一天后继续发起自动扣款。此时，即使借款人已逾期，只要还款账户内有足够资金，银行系统仍会按合同执行扣款操作。
   法律依据：根据《民法典》第六百七十五条，借款人应按约定期限还款，而自动扣款是银行为实现债权采取的合法技术手段，合同约定优先。

2. 贷款合同未明确约定逾期后自动扣款
   若合同未明确约定逾期后的扣款规则，银行通常不会在逾期后单方面变更扣款方式（如逾期后突然启动扣款）。此时，银行更可能通过短信、电话等方式提醒借款人手动还款，或按合同约定的逾期罚息条款处理，而非直接自动扣款。
   实务建议：即使合同未明确约定，借款人仍应主动联系银行确认还款方式，避免因疏忽导致逾期记录或额外费用。

3. 特殊情况：还款账户余额不足或系统故障
   即使合同约定了自动扣款，若逾期当天账户余额不足，或银行系统因故障未能完成扣款，银行可能不会在逾期一天后补扣（除非合同明确约定补扣规则）。此时，借款人需手动还款，并保留还款凭证，避免银行以“未还款”为由主张违约责任。
   风险提示：若因系统故障导致未扣款，借款人仍需承担举证责任（如提供账户流水、系统故障通知等），否则可能被认定为“主观逾期”。

总结与建议：

• 优先查看合同：立即翻阅贷款合同中“还款方式”“逾期处理”等条款，明确是否有自动扣款的约定。
  
• 主动沟通银行：若合同条款不明确，或逾期后未收到扣款通知，建议第一时间联系银行客服，确认还款方式及逾期后果。
  
• 保留还款证据：无论自动扣款还是手动还款，均需保留转账记录、短信通知等凭证，以防纠纷。
  

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