您好，关于您提出的“刑法的证据标准三个层次”的问题，这是一个涉及刑事诉讼中认定被告人有罪所需达到的证据要求和证明程度的重要议题。以下是我为您详细梳理的三个层次的证据标准：
一、立案阶段的证据标准——“认为有犯罪事实”
在立案阶段，公安机关或人民检察院在接到报案、控告、举报等材料后，会进行初步审查。此时，所需的证据标准是“认为有犯罪事实”。这意味着，虽然不需要查清全部犯罪事实和情节，但必须有一定的证据证明发生了犯罪事实。例如，现场有打斗痕迹、财物丢失，且有目击证人看到可疑人员出现在现场等，这些证据足以让公安机关认为有犯罪事实发生，从而决定立案侦查。
二、逮捕阶段的证据标准——“有证据证明有犯罪事实”
逮捕阶段是对立案阶段证据标准的进一步细化和强化。此时，要求同时具备三个情形：一是有证据证明发生了犯罪事实；二是有证据证明该犯罪事实是犯罪嫌疑人实施的；三是证明犯罪嫌疑人实施犯罪行为的证据已经查证属实。以抢劫案为例，如果公安机关获取了犯罪嫌疑人的指纹留在现场的凶器上，且有销赃记录等证据，这些证据不仅证明了有抢劫犯罪事实发生，而且有证据证明该犯罪事实是犯罪嫌疑人实施的，并且这些证据已经查证属实，满足逮捕阶段的证据标准。
三、定罪阶段的证据标准——“事实清楚，证据确实、充分”
定罪阶段是刑事诉讼中最为关键的环节，此时的证据标准也是最为严格的。它要求：
定罪量刑的事实都有证据证明：即作为认定犯罪嫌疑人、被告人犯罪、犯罪情节轻重以及确定刑事责任的各种事实，如犯罪行为是否发生、谁是犯罪行为的实施者、犯罪的时间地点手段后果等，都必须有相应的证据加以证明。
据以定案的证据均经法定程序查证属实：强调证据的合法性和真实性。证据必须是通过合法的方式收集，并经过法庭的质证和认证，确认其真实可靠。
综合全案证据，对所认定事实已排除合理怀疑：这意味着在综合审查全案证据的基础上，必须排除所有合理的怀疑，得出唯一的结论。证据之间应当相互印证，形成一个完整的证据链，且不存在无法解释的矛盾或疑点。例如，在故意杀人案件中，如果有多名目击证人看到被告人在案发时间在现场，法医鉴定报告显示被害人系他杀且死亡时间与被告人供述的作案时间相符，现场提取到的凶器上有被告人的指纹等，这些证据相互印证，形成了一个完整的证据链条，排除了其他合理怀疑，达到了定罪的标准。
希望以上解答能够清晰地帮助您理解刑法的证据标准三个层次。如果您还有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。