针对您提出的问题，即“一个承包合同两个户口本两个确权证，父母双亡是否算整户消亡”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：
首先，我们需要明确“整户消亡”的定义。根据《中共中央 国务院关于保持土地承包关系稳定并长久不变的意见》中的规定，“因家庭成员全部死亡而导致承包方消亡的，发包方应当依法收回承包地，另行发包”。这里的“承包方消亡”指的是承包土地的家庭成员全部死亡，导致承包户不再存在的情况。
接下来，我们分析您提供的具体情况：
承包合同与确权证：您提到有一个承包合同和两个确权证，且涉及两个户口本。这通常意味着在土地承包时，父母与子女可能已经分户，但各自仍保留有承包土地的权利，并获得了相应的确权证。
父母双亡：父母去世后，如果子女等直系亲属仍然健在，并且他们仍然是本村集体经济组织的成员，那么情况就并非简单的“整户消亡”。
子女等直系亲属的情况：根据《中华人民共和国农村土地承包法》的规定，“家庭承包的承包方是本集体经济组织的农户”。这里的“农户”指的是土地承包户，而非户籍的“户”。如果子女等直系亲属仍然健在，并且他们仍然是本村集体经济组织的成员，那么他们仍然有权继续承包经营父母名下的土地。
现在，我们结合上述分析来回答您的问题：
在您描述的情况下，虽然父母已经去世，但如果子女等直系亲属仍然健在，并且他们仍然是本村集体经济组织的成员，那么这并不构成“整户消亡”。因为承包土地的权利仍然由健在的子女等直系亲属继续享有和行使。
关于未来的政策，虽然具体的政策可能会因地区和时间的不同而有所变化，但一般来说，政府会尊重历史原则，坚持以农村土地二轮承包台账、承包合同和承包经营权证等相关原始资料为主要合法佐证，来确认承包地的权属。因此，只要子女等直系亲属仍然是本村集体经济组织的成员，他们就有权继续承包经营父母名下的土地。
综上所述，一个承包合同两个户口本两个确权证的情况下，父母双亡并不构成整户消亡，只要子女等直系亲属仍然健在且是本村集体经济组织的成员，他们就有权继续承包经营相关土地。