在同一个判决中，若处罚决定合法而复议决定确认违法，主文的表述应当清晰、准确，并分别阐述处罚决定与复议决定的合法性及处理结果。以下是从不同角度对主文表述的分析和建议：

1. 处罚决定合法的表述：

   • 在判决主文中，应明确指出处罚决定是合法的，并简要说明其合法性的依据。例如：“本院经审理认为，被告作出的XX处罚决定，事实清楚，证据确凿，适用法律正确，程序合法，依法应予维持。”

2. 复议决定确认违法的表述：

   • 对于复议决定确认违法的情况，判决主文应明确指出复议决定存在违法之处，并说明违法的具体理由。例如：“然而，被告作出的XX复议决定，在认定事实或适用法律上存在错误，依法应予以撤销或确认违法。”但在此情境下，由于我们讨论的是“确认违法”而非“撤销”，所以更准确的表述可能是：“被告作出的XX复议决定，确认了原处罚决定中的某部分或全部违法，但经本院审查，该确认违法部分是基于对事实或法律的错误理解，不过，鉴于复议决定本身已作出确认违法的结论，且该结论对原告权利义务产生实际影响，本院在此对复议决定的违法性予以确认，并指出其错误所在。”（但实际操作中，若复议决定确认违法且该确认无误，则直接表述为确认复议决定违法即可，此处为全面分析而提供复杂情形说明）
   • 简化且更常见的表述（在复议决定确实违法时）：“本院确认被告作出的XX复议决定违法，因其……（具体说明违法理由）。”

3. 综合表述：

   • 在同一个判决中，需要综合上述两点，清晰区分处罚决定与复议决定的合法性。例如：“本院经审理认为，被告作出的XX处罚决定，事实清楚，证据确凿，适用法律正确，程序合法，依法应予维持；但被告作出的XX复议决定，确认了原处罚决定中的某部分或全部违法，该确认缺乏事实或法律依据，依法应确认该复议决定违法。”

   • 若复议决定确认违法是基于对原处罚决定中某部分错误的正确指出（但这种情况较为特殊，因为通常复议决定会撤销或变更违法部分，而非仅确认违法）：此时判决主文需更细致地区分，如：“本院确认被告作出的XX复议决定中关于……（具体指出哪部分）的确认违法是正确的，因该部分确实存在……（违法事实或理由）；但复议决定未对原处罚决定的其他合法部分进行正确维持，且其整体处理方式（如仅确认违法而未撤销或变更）不符合法律规定，故本院对复议决定的该处理方式亦确认违法，并维持原处罚决定中除……（被复议决定正确指出违法的部分，若需法院进一步处理则说明）外的其他部分。”（但此情形较为复杂且不常见，通常复议决定会直接撤销或变更违法部分）

   • 更常见且简洁的综合表述（在复议决定错误确认处罚决定合法部分为违法时）：“本院维持被告作出的XX处罚决定，因其合法有效；同时，本院确认被告作出的XX复议决定违法，因其错误地确认了原处罚决定中的合法部分为违法。”

在实际操作中，判决主文的表述应更加精炼且符合法律文书的要求。重要的是要确保判决主文能够清晰、准确地反映法院对处罚决定和复议决定的审查结果及法律依据。

建议：在撰写判决主文时，务必仔细审查案件事实、证据及法律依据，确保表述的准确性和合法性。如有需要，可参考类似案例的判决主文表述方式，以确保判决的规范性和一致性。若您在具体案件中遇到此类问题，可直接向我咨询，我将根据案件具体情况提供更详细的法律意见。