结论：员工上六休一，每周超过44小时是否违反劳动法，需根据具体的工作时长、休息安排以及是否支付加班费等因素综合判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、标准工时制度下的情况
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
- 同时，该法第三十八条规定，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。
合法性分析：
- 若员工上六休一，但每天工作时间不超过8小时，且累计每周工作时间不超过44小时，同时确保了每周至少有一天的休息时间，那么这种工作安排是符合法律规定的，不构成违法。
- 若员工上六休一，导致周工作时间超过44小时，且未安排补休或支付加班工资，则违反劳动法。例如，员工每天工作8小时，6天即48小时，超出了法定工作时间上限，此时构成违法。
二、特殊工时制度下的情况
综合计算工时工作制：
- 适用于交通、铁路、邮电等因工作性质特殊需连续作业的行业。
- 采用集中工作、集中休息等方式，只要在综合计算周期内总工作时间不超过法定标准，上六休一则是合法的。例如，某周期内员工虽上六休一，但平均每周工作时间未超40小时（或44小时，视具体规定），故合法。
不定时工作制：
- 适用于工作时间和休息时间无法固定的岗位，如高级管理人员、销售代表等。
- 不受固定工时限制，只要保证每周至少休息一日，上六休一合法。例如，销售代表工作时间不固定，公司确保他每周至少休息一天，这种上六休一安排合法。
三、加班与补偿规定
- 延长工时限制：劳动法第四十一条规定，用人单位因生产经营需要延长工时，每日不得超过1小时；特殊原因需延长的，在保障健康前提下每日不得超3小时，每月总计不得超36小时。
- 加班费支付义务：若上六休一导致超时工作，用人单位须按以下标准支付加班费：
- 工作日延长工时：不低于工资的150%；
- 休息日加班且无法补休：不低于工资的200%；
- 法定节假日加班：不低于工资的300%。
四、劳动者权益保护建议
- 关注工作时间：劳动者应时刻关注自己的工作时间，确保不超过法定上限。
- 要求休息权益：确保每周至少有一天的完整休息时间，这是法律赋予劳动者的基本权益。
- 索要加班费：在超时工作的情况下，劳动者有权要求用人单位支付加班费。若用人单位拒绝支付，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。
示例说明：
- 假设员工小张在一家工厂工作，实行标准工时制。他每周上六休一，每天工作8小时，那么他的周工作时间为48小时，超出了法定工作时间上限。此时，工厂应支付小张加班费或安排调休，否则构成违法。
- 假设员工小李在一家销售公司工作，实行不定时工作制。他每周上六休一，但工作时间不固定，且公司确保他每周至少休息一天。此时，小李的工作安排是合法的。
综上所述，员工上六休一，每周超过44小时是否违反劳动法，需根据具体情况综合判断。劳动者应了解自己的权益，并在必要时采取合适的措施来保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。