子公司能否自行清算注销需分情况讨论，具体取决于子公司的性质、股东结构及公司章程规定。以下从不同角度展开分析：

1. 全资子公司
   若子公司为母公司全资持有（即唯一股东），根据《公司法》及相关司法解释，全资子公司可由母公司作为唯一股东决定清算注销。此时需履行以下程序：

   • 股东作出书面清算决定（需符合公司章程规定的表决比例）；
     
   • 成立清算组（通常由母公司指派人员组成）；
     
   • 完成清算后，向登记机关申请注销登记。
     关键点：全资子公司因股东单一，决策效率较高，但需确保清算程序合法（如通知债权人、公告等），避免因程序瑕疵导致清算无效。

2. 非全资子公司（含多名股东）
   若子公司存在多名股东（包括母公司与其他股东），清算注销需经全体股东一致同意或按公司章程约定比例表决通过。程序要求更严格：

   • 股东会或股东大会作出特别决议（通常需2/3以上表决权通过）；
     
   • 清算组需由股东代表、董事或专业机构组成；
     
   • 清算过程中需保障少数股东权益（如异议股东回购请求权）。
     风险点：若股东间存在矛盾，可能因无法达成决议导致清算停滞，此时需通过司法解散或强制清算程序解决。

3. 特殊类型子公司

   • 上市公司子公司：需遵守证监会及交易所的额外规定（如信息披露、关联交易审查等）；
     
   • 外资子公司：涉及商务部门、外汇管理等审批程序；
     
   • 国有控股子公司：需履行国资监管程序（如资产评估、进场交易等）。
     提示：此类子公司清算需提前咨询主管部门，避免因监管合规问题延误注销。

实务建议：

1. 优先审查子公司章程，确认清算条款是否对股东权利有特殊约定；
   
2. 清理子公司债权债务，避免遗留纠纷（如未结诉讼、担保责任等）；
   
3. 注销前完成税务清算（需取得税务机关出具的清税证明）；
   
4. 涉及跨境或复杂股权结构的，建议提前规划税务优化方案。
   

如有具体案例或细节需进一步分析，可直接向我说明，我会结合实际情况提供操作指引。