两个立项批复使用一个资金是否合法，不能一概而论，需分情况讨论：

1. 若资金性质与用途明确且符合规定
   如果两个立项批复对应的项目在资金性质、用途、管理方式上完全一致，且符合相关法律法规对资金使用的具体要求（例如，资金来源为同一专项资金池，且两个项目均属于该专项资金支持范围），则使用同一资金可能是合法的。但需注意，这种情况下通常需要满足严格的审批程序，例如需在立项批复中明确资金分配比例或使用规则，并确保资金使用符合预算安排和财务制度。

2. 若资金性质或用途存在冲突
   如果两个立项批复对应的项目在资金性质（如财政资金与社会资本）、用途（如基建项目与科研项目）或管理要求（如专款专用与可调剂使用）上存在差异，则使用同一资金可能涉嫌违法。例如：

   • 专款专用原则：若资金属于财政专项资金，通常需“专款专用”，不得跨项目调剂使用，否则可能违反《预算法》《财政违法行为处罚处分条例》等规定；
     
   • 资金混同风险：若资金来源涉及不同主体（如政府投资与企业自筹），混用可能导致产权不清、审计风险或利益冲突，甚至构成挪用资金或诈骗等刑事犯罪。

3. 程序合规性是关键
   即使资金性质和用途理论上兼容，若未履行必要的审批程序（如未在立项阶段明确资金分配方案、未获得财政部门或上级主管部门的书面同意），仍可能因程序违法被认定为无效。例如，根据《政府投资条例》，政府投资项目需严格按批复的预算执行，擅自调整资金用途可能面临行政处罚。

建议：

• 立即核查两个立项批复中关于资金来源、用途、管理方式的条款，确认是否存在冲突；
  
• 梳理资金使用记录，确保每笔支出均符合批复要求及财务制度；
  
• 若存在不确定性，建议补充履行审批程序（如申请资金调剂备案）或咨询专业律师进行合规性审查，以规避法律风险。
  

如有进一步细节（如资金类型、项目性质等），可随时补充说明，我会为您深入分析。