结论：强制执行中只查封到有抵押的车辆，后续是否会拍卖需分情况讨论，但总体而言，在满足一定条件下车辆大概率会被拍卖。以下为你详细分析：

抵押权不影响拍卖的进行

从法律层面来讲，抵押权并不阻碍法院对抵押车辆的拍卖。依据《中华人民共和国民法典》相关规定，为担保债务的履行，债务人或者第三人不转移财产的占有，将该财产抵押给债权人的，债务人不履行到期债务或者发生当事人约定的实现抵押权的情形，债权人有权就该财产优先受偿。在强制执行程序中，法院查封车辆是为了保障申请执行人的权益得以实现，即便车辆设有抵押，法院也有权对其进行处置，通过拍卖等方式将车辆变现。

例如，甲向乙借款，并将自己的车辆抵押给乙作为担保。后来甲未能按时还款，乙向法院起诉并申请强制执行。此时，法院查封了甲的抵押车辆，即便车辆存在乙的抵押权，法院依然可以启动拍卖程序。

拍卖后抵押权人的权益保障

虽然车辆会被拍卖，但抵押权人的合法权益会得到保障。在拍卖车辆所得的价款中，抵押权人有优先受偿的权利。也就是说，拍卖车辆获得的款项，会先用于偿还抵押权人的债务，如果有剩余，再用于偿还其他普通债权人的债务。

假设上述例子中，车辆拍卖后获得价款20万元，甲欠乙的债务为15万元，那么这20万元会先偿还乙的15万元债务，剩余的5万元再按照法定顺序分配给其他债权人。

可能影响拍卖的情况

1. 抵押权人与债务人达成和解：如果在强制执行过程中，抵押权人（债权人）与债务人达成和解协议，例如债务人承诺在一定期限内偿还债务，或者提供其他担保方式等，抵押权人可能会向法院申请暂缓或终止拍卖程序。
2. 车辆存在其他权利瑕疵：如果车辆除了抵押权外，还存在其他权利限制，如被多个法院查封、存在租赁关系且租赁期限较长等，这些情况可能会增加拍卖的难度和复杂性，甚至导致拍卖无法顺利进行。不过，这些情况并不意味着绝对不能拍卖，法院会根据具体情况进行判断和处理。
3. 拍卖无人问津或流拍：如果车辆经过多次拍卖，均无人出价或者出价低于保留价导致流拍，法院可能会根据相关规定，以物抵债给申请执行人，或者将车辆退还被执行人（债务人），但这种情况相对较少。

建议：如果你作为申请执行人，在车辆拍卖过程中要密切关注拍卖进展，及时与法院沟通；如果作为被执行人，若不想车辆被拍卖，可以积极与申请执行人协商还款方案，争取达成和解。若你在债务债权（抵押担保）方面还有其他疑问，欢迎直接向我咨询。