大中型水利水电工程临时用地补偿的支付主体问题，需结合具体法律法规及工程实际情况综合判断，但通常情况下，施工单位并非直接支付主体，而是由建设单位或政府相关部门负责支付，施工单位可能承担代付或协助义务。以下从不同角度详细分析：

1. 法律法规层面

• 《土地管理法》及其实施条例：明确规定因工程建设需要临时使用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门批准，并按照临时使用土地合同约定支付临时使用土地补偿费。这里的“支付主体”通常是建设单位（如水电站项目法人），而非施工单位。
• 《大中型水利水电工程建设征地补偿和移民安置条例》：针对水利水电工程，该条例进一步规定，临时用地补偿费由项目法人（即建设单位）支付，施工单位一般不直接承担支付责任，但可能需协助建设单位完成补偿工作。

2. 合同关系层面

• 建设单位与施工单位的合同：若施工合同中明确约定施工单位需承担临时用地补偿费用，则施工单位可能成为支付主体。但此类约定需符合法律法规，且不得损害农民合法权益。
• 建设单位与土地使用者的协议：通常由建设单位直接与土地使用者（如村集体或农户）签订临时用地协议，并约定补偿标准及支付方式。施工单位仅作为工程实施方，不直接参与补偿协议签订。

3. 实际操作层面

• 代付或垫付情况：在部分工程中，为加快进度，建设单位可能要求施工单位先行垫付补偿费用，后续再由建设单位与施工单位结算。但此行为需有明确合同依据，否则施工单位可能面临资金风险。
• 政府主导补偿：对于涉及公共利益的重大工程，政府可能直接介入补偿工作，确保补偿及时、足额发放。此时，施工单位仅需配合政府完成相关手续。

4. 法律风险与建议

• 施工单位风险：若施工单位未经授权擅自支付补偿费用，可能面临建设单位拒不认账、土地使用者重复索赔等风险。
• 建议：
  1. 明确合同条款：施工单位在签订施工合同时，应明确约定临时用地补偿费用的承担主体及支付方式，避免模糊表述。
  2. 留存证据：若需代付或垫付补偿费用，应要求建设单位出具书面委托，并保留支付凭证、土地使用者签收记录等证据。
  3. 咨询专业律师：涉及复杂补偿问题时，建议及时咨询律师，确保操作合法合规，降低法律风险。

总结：大中型水利水电工程临时用地补偿的支付主体通常为建设单位或政府相关部门，施工单位一般不直接承担支付责任。但具体需结合法律法规、合同约定及工程实际情况判断。如有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体案情提供专业法律意见。