分居三年后起诉离婚，法院并不一定会直接判决离婚，但分居三年是法院判断夫妻感情是否确已破裂的一个重要考量因素。以下从多个角度为你详细分析：
一、满足法定离婚条件的情况
根据《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条的规定，夫妻因感情不和分居满二年，调解无效的，应当准予离婚。分居三年，从时间上看已经满足了这一法定条件。但关键在于，分居必须是由于夫妻双方感情出现问题导致的，而非工作、学习等客观原因造成的两地分居。这是判断分居性质的关键，也是法院在判决时重点审查的内容。
举例说明：如果夫妻双方因为感情不和，已经分居三年，且在这期间没有共同生活、互不履行夫妻义务，同时一方提起离婚诉讼，若调解无效，法院通常会认定夫妻感情确已破裂，从而判决准予离婚。
二、不满足法定离婚条件的情况
分居原因非感情不和：如果分居并非因感情不和，而是由于工作、学习、就医等客观原因导致的两地分居，即使分居时间达到或超过三年，也不符合“因感情不和分居”的法定离婚条件，法院一般不会以此为依据判决离婚。
无法提供有效证据：在诉讼中，证据是关键。如果当事人无法提供足够的证据来证明分居事实及分居原因，如没有书面分居协议、租房合同、居委会证明以及聊天记录、邮件等，法院难以认定夫妻感情确已破裂，因此可能不会判决离婚。
存在和好可能：法院在审理离婚案件时，会综合考虑各种因素判断夫妻感情是否还有挽回的余地。即使存在分居的情况，但如果双方在分居期间仍有相互关心、共同处理家庭事务等行为，表明双方仍有和好的意愿和可能，法院也可能不会轻易判决离婚。
三、法院的综合考量
即便满足了“因感情不和分居满二年”的法定条件，法院在审理离婚案件时仍会进行综合考量，包括但不限于以下几个方面：
双方的感情基础和婚后状况：法院会评估夫妻双方的婚前感情基础是否牢固，以及婚后感情是否出现了不可调和的裂痕。
子女抚养问题：子女的年龄、抚养权归属、对子女成长的影响等也是法院判决时会考虑的重要因素。
财产分割情况：夫妻共同财产的分割是否公平合理，双方是否有隐瞒、转移财产等行为，也会影响法院的判决。
调解的可能性：法院在判决前会先行调解，试图挽救婚姻关系。只有在调解无效，且确认夫妻感情确已破裂的情况下，才会判决离婚。
四、建议与操作指南
为了提高离婚诉讼的成功率，我建议你：
积极收集并整理相关证据：包括分居协议、租房合同、居委会证明、聊天记录、邮件等，以证明分居的事实和感情破裂的情况。
理性对待离婚诉讼：尊重法院的综合判断，不要过分强求或抱有不切实际的期望。
寻求专业帮助：在必要时，可以寻求像我这样的专业律师的帮助，以确保自己的合法权益得到妥善维护。
综上所述，分居三年虽可作为离婚诉讼中的一个重要考量因素，但并非决定性因素。法院会根据具体情况进行综合判断，以确保判决的公正性和合理性。如果你有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。