合作出书质检不合格时，出版社不一定会直接罚款，但可能根据合同约定或法律规定采取其他措施。具体分析如下：

1. 合同约定优先：在合作出书的过程中，出版社与作者或合作方通常会签订出版合同。合同中会明确规定双方的权利和义务，包括图书质量的标准、质检不合格的处理方式等。如果合同中明确约定了质检不合格时出版社有权罚款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么出版社在质检不合格时是有权按照合同约定进行罚款的。但如果合同中没有明确约定罚款条款，出版社则不能直接罚款。

2. 法律规定与行业惯例：在出版行业，图书质量是出版社的生命线。虽然法律法规可能没有直接规定质检不合格时出版社可以罚款，但出版社为了维护自身声誉和读者利益，通常会在合同中设置严格的质量标准，并约定相应的违约责任。这些违约责任可能包括要求合作方承担返工、重印、赔偿损失等费用，而不一定是直接罚款。

3. 出版社的内部管理：除了合同约定和法律规定外，出版社还可能根据自身的内部管理制度对质检不合格的情况进行处理。这些处理方式可能包括要求合作方进行整改、暂停合作、解除合同等。在某些情况下，出版社也可能会根据内部规定对合作方进行一定的经济处罚，但这种处罚通常需要基于合同约定或法律法规的授权。

4. 建议与应对：对于合作方来说，为了避免因质检不合格而面临罚款或其他不利后果，应当在签订出版合同时仔细阅读合同条款，特别是关于图书质量和违约责任的部分。如果合同中存在不合理的罚款条款或其他不公平的约定，应当及时与出版社协商修改。同时，合作方也应当加强自身的质量管理，确保出版的图书符合合同约定的质量标准。