您好，关于您提出的“在什么部门证明兄妹关系”的问题，这通常涉及到需要出具亲属关系证明的情况。以下是我为您详细梳理的解答：

首先，要证明兄妹关系，最直接且有效的方式是通过公安机关的户籍部门。当居民在办理社会事务时，如果所持的户口证件不能直接反映兄妹之间的亲属关系，但在户籍历史档案中可以查找到相关记录，那么您可以向当地的公安机关户籍窗口提出申请，要求出具亲属关系证明。在申请时，您需要准备以下材料：

1. 书面申请报告：在这份报告中，您需要详细陈述申请的事由以及您所掌握的兄妹关系的线索。

2. 申请人居民身份证：这是为了确认您的身份，确保申请的真实性和合法性。

提交上述材料后，户籍窗口会进行受理和调查，并在5个工作日内为您办结出具亲属关系证明。这份证明将明确标注您与兄妹之间的亲属关系，并加盖公安机关户口专用章，具有法律效力。

除了通过公安机关户籍部门证明兄妹关系外，还有其他一些方式也可以作为辅助证明：

• 如果您的兄妹关系在公安部人口信息系统或相关地方人口信息管理系统中已有记载，那么受理业务的民警可以直接查询并证明。
• 您也可以提供《出生医学证明》、《收养登记证》（如适用）、《事实收养公证书》（如适用）等证照或文件来证明兄妹关系。
• 如果历史户籍档案或信息中能够证明您与兄妹的历史户成员关系，业务受理民警也可以查询并证明。
• 您还可以提供历史（现用）居民户口簿作为证明材料。
• 公证机构出具的《亲属关系公证书》也是有效的证明方式。
• 在某些情况下，有资质的亲子鉴定机构出具的亲子鉴定书也可以作为证明兄妹关系的依据。

综上所述，证明兄妹关系最直接且有效的方式是通过公安机关的户籍部门。同时，根据具体情况，您也可以选择其他辅助证明方式。希望这些解答能够帮助到您，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。