个人付房租给公司，但让别的公司代付房租，在税务上是否合法，这主要取决于具体的税务规定和操作方式。以下从几个关键角度进行分析：

1. 税务合规性角度：

   • 代付行为的本质：代付房租本身并不直接违反税务法规，但关键在于这种代付行为是否符合税务上的“实际支付”原则。即，房租的实际承担者（个人）与支付者（代付公司）之间需要有明确的协议或安排，且这种安排不能违反税务法规的强制性规定。
   • 税务发票的开具：在税务上，房租的支付通常需要相应的发票作为凭证。如果代付公司能够按照税务规定开具或转交房租发票给实际支付者（个人），且发票上的信息（如付款方、收款方、金额等）与实际情况相符，那么这种代付行为在税务上通常是可接受的。
   • 税务申报与缴纳：个人作为房租的实际承担者，需要按照税务规定进行申报和缴纳相关税费（如个人所得税、房产税等，具体取决于当地税务法规）。代付公司如果仅作为支付中介，不涉及房租的税务处理，则无需承担额外的税务责任。但需注意，如果代付公司与个人之间存在某种形式的利益输送或避税安排，则可能涉及税务违法问题。

2. 合同与法律关系角度：

   • 租赁合同的约定：首先，需要查看个人与公司之间的租赁合同是否允许代付房租。如果合同中有明确约定，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么代付行为在合同层面是合法的。
   • 代付协议的签订：为了保障双方的权益，个人与代付公司之间最好签订一份代付协议，明确双方的权利义务、代付金额、代付方式、税务处理等事项。这样可以在发生纠纷时提供有力的法律证据。

3. 潜在风险与建议：

   • 税务风险：如果代付行为被税务机关认定为避税或偷税行为，个人和代付公司都可能面临税务处罚。因此，在进行代付操作时，务必确保符合税务法规的要求。
   • 法律风险：如果代付行为违反了租赁合同的约定或相关法律法规的强制性规定，个人和代付公司都可能面临法律纠纷和赔偿责任。因此，在进行代付操作前，务必咨询专业律师的意见，确保操作的合法性和合规性。
   • 建议：为了避免潜在的税务和法律风险，建议个人在支付房租时尽量直接支付给房东或房东指定的收款方，并确保取得合法的税务发票。如果确实需要代付，应与代付公司签订详细的代付协议，并咨询专业律师和税务师的意见。

总结来说，个人付房租给公司但让别的公司代付房租在税务上是否合法，取决于具体的税务规定、操作方式以及合同与法律关系的约定。为了确保合法性和合规性，建议在进行代付操作前咨询专业律师和税务师的意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。