审计局发现公职人员注册公司，一般会根据具体情况进行严肃处理，具体处理方式需结合公职人员的行为性质、是否违反法律法规及党纪政纪等因素综合判断。以下是详细分析：

1. 若公职人员注册公司行为违反法律法规
   根据《中华人民共和国公务员法》第五十九条第十六项规定，公务员不得“违反有关规定从事或者参与营利性活动，在企业或者其他营利性组织中兼任职务”。若公职人员未经批准注册公司并实际经营，可能构成“违规从事营利活动”，审计局会将线索移交纪检监察机关或任免机关，由其依据《中国共产党纪律处分条例》《中华人民共和国公职人员政务处分法》等规定，给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等政务处分；若涉及贪污受贿、滥用职权等犯罪行为，还将移送司法机关追究刑事责任。

2. 若公职人员注册公司行为未违反法律法规，但违反党纪政纪
   即使公职人员注册的公司未实际经营，或符合特定例外情形（如经批准参与科研创新、社会服务等），但若未履行报备手续或违反单位内部管理规定，仍可能被认定为“违反组织纪律”。审计局会建议其所在单位或纪检监察机关对其进行批评教育、责令整改，或给予诫勉谈话、通报批评等组织处理。

3. 若公职人员注册公司行为合法合规
   极少数情况下，公职人员可能因特定政策允许（如参与扶贫项目、科技成果转化等）注册公司，且已按程序报备并获得批准。此时审计局通常不会直接处理，但会核查其经营行为是否符合政策要求，若存在违规操作（如利用职务便利谋取私利），仍会按上述第一种情形处理。

补充说明：

• 审计局本身无直接处分权，但作为监督机关，其发现线索后会移交有权机关处理，并可能参与后续调查。
  
• 公职人员需特别注意“利益冲突”问题，即使注册公司未直接违法，若与其职务存在关联或可能影响公正履职，仍可能被认定为违规。
  

建议：若您或您身边的人涉及此类情况，建议立即梳理注册公司的目的、经营行为及报备情况，必要时可向我进一步咨询具体应对策略。