针对您提出的“新三板代持协议无效的处理后果”这一问题，我将结合相关法律实践和案例，为您详细解答。

首先，我们需要明确的是，新三板挂牌公司的股权代持协议，其法律效力在司法实践中存在一定的争议。这主要是因为新三板市场与主板市场在监管规则、信息披露要求等方面存在差异，导致股权代持协议的效力认定标准并不完全统一。然而，从一般法律原则出发，如果代持协议违反了法律法规的强制性规定，或者损害了社会公共利益、第三人利益等，那么该协议很可能被认定为无效。

当新三板代持协议被认定为无效时，其处理后果主要包括以下几个方面：

1. 股权归属的恢复：

   • 代持协议无效后，原本由名义股东代持的股权，其实际权益应归属于实际出资人（即隐名股东）。但这一归属的恢复并非自动实现，而是需要通过法律程序，如诉讼或仲裁，来确认股权的实际归属。

2. 返还财产与赔偿损失：

   • 如果名义股东因代持协议获得了不当利益（如股权转让款、分红等），实际出资人有权要求其返还。
   • 同时，如果因代持协议无效导致实际出资人遭受了损失（如资金占用利息、交易机会丧失等），名义股东也应承担相应的赔偿责任。

3. 税务处理：

   • 代持协议无效后，可能涉及税务问题的处理。例如，股权转让所得的税务申报、缴纳等，需要根据实际股权归属情况进行调整。

4. 对公司及其他股东的影响：

   • 代持协议无效可能对公司及其他股东产生一定影响。例如，股权结构的变动可能影响公司的决策机制、治理结构等。因此，在处理代持协议无效问题时，需要充分考虑公司及其他股东的利益，确保处理结果的公平性和合理性。

5. 法律程序的遵循：

   • 在处理代持协议无效问题时，必须严格遵循法律程序。这包括提起诉讼或仲裁、提交证据、参与庭审等。只有通过法律程序，才能确保处理结果的合法性和有效性。

结合具体案例：

以您提供的案例为例，当中院民二庭在处理一起涉及新三板挂牌公司“股份转让+代持”模式的股权转让纠纷案件时，就关注到了代持协议效力的认定规则、代持协议无效时相应股权及其权益的处置等争议焦点问题。最终，通过数次调解，双方达成了一致调解意见，圆满化解了矛盾纠纷。这一案例表明，在处理新三板代持协议无效问题时，法院会综合考虑各种因素，包括法律适用、案件事实、当事人利益等，以寻求最合理的解决方案。

建议：

• 对于涉及新三板代持协议的当事人来说，应充分了解相关法律法规和监管要求，避免签订违法或无效的代持协议。
• 如果代持协议已经签订且存在无效风险，当事人应及时咨询专业律师，评估风险并制定应对策略。
• 在处理代持协议无效问题时，当事人应积极配合法律程序，提交相关证据和材料，以维护自己的合法权益。

综上所述，新三板代持协议无效的处理后果涉及多个方面，包括股权归属的恢复、返还财产与赔偿损失、税务处理、对公司及其他股东的影响以及法律程序的遵循等。当事人在处理此类问题时，应充分了解相关法律法规和监管要求，并咨询专业律师的意见。