集体所有制改制为股份合作制过程中若存在不公平情形，是可以进行倒查的。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律背景与依据

1. 改制合法性审查：集体所有制企业改制为股份合作制，必须遵循相关法律法规和政策规定，确保改制程序的合法性和公正性。如果改制过程中存在违法违规行为，如资产评估不实、隐瞒债务、违规处置资产等，相关责任人将承担法律责任。因此，对改制过程的倒查，实际上是对改制合法性的审查。

2. 股东权益保护：在股份合作制企业中，股东享有相应的权益，包括资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。如果改制过程中存在不公平情形，如部分股东权益被侵害、资产分配不均等，股东有权通过法律途径维护自己的合法权益。倒查改制过程，有助于揭示不公平情形的存在，为股东维权提供依据。

二、倒查的途径与方式

1. 内部审查：企业可以成立专门的审查小组，对改制过程进行全面审查。审查小组可以包括企业高管、职工代表、法律顾问等，确保审查的公正性和客观性。通过查阅改制文件、会议记录、资产评估报告等资料，揭示改制过程中可能存在的不公平情形。

2. 外部审计：企业可以聘请专业的审计机构对改制过程进行外部审计。审计机构具有独立性和专业性，能够对企业改制过程中的财务状况、资产处置、债务承担等方面进行全面审计，发现可能存在的问题和风险。

3. 法律诉讼：如果改制过程中存在严重的不公平情形，且内部审查和外部审计无法解决问题，股东或相关利益方可以通过法律诉讼途径维护自己的权益。法院将对改制过程进行司法审查，判断改制是否合法、公正，并作出相应的判决。

三、倒查可能面临的挑战与应对

1. 证据收集困难：改制过程可能涉及多个环节和多个主体，证据收集可能面临困难。因此，在倒查过程中，应注重证据的收集和保存，包括改制文件、会议记录、资产评估报告、合同协议等。同时，可以寻求法律专业人士的帮助，确保证据的合法性和有效性。

2. 法律程序复杂：倒查改制过程可能涉及多个法律程序，如内部审查、外部审计、法律诉讼等。这些程序可能耗时较长、成本较高。因此，在倒查前应充分评估法律程序的复杂性和成本，制定合理的倒查计划。同时，可以寻求法律专业人士的指导，确保倒查过程的顺利进行。

四、建议与措施

1. 加强改制过程监管：在改制过程中，应加强对改制程序的监管，确保改制过程的合法性和公正性。可以设立专门的监管机构或委托第三方机构进行监管，对改制过程中的关键环节进行监督和检查。

2. 完善信息披露制度：改制过程中应完善信息披露制度，确保所有股东和相关利益方能够及时了解改制进展和相关信息。通过公开透明的信息披露，减少信息不对称和利益冲突，维护股东的合法权益。

3. 建立纠纷解决机制：在改制过程中，应建立纠纷解决机制，及时化解可能出现的矛盾和纠纷。可以设立专门的纠纷调解机构或委托第三方机构进行调解，通过协商、调解等方式解决纠纷，避免矛盾升级和法律诉讼的发生。

如果你在集体所有制改制股份合作制过程中遇到了不公平情形，或者对改制过程有疑问，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。