医疗定点机构注销后，其之前违规获取的资金通常需要依法追回，并可能面临相应的行政处罚或刑事责任，具体处理方式需根据违规性质、资金用途及法律规定综合判断。以下是详细分析：

1. 违规资金的性质认定与追回
   若医疗定点机构通过虚构医疗服务、伪造票据、套取医保基金等违规手段获取资金，此类资金属于“违法所得”。根据《医疗保障基金使用监督管理条例》第四十条，医保行政部门有权责令退回违规资金，并处以罚款。即使机构已注销，其法定代表人、实际控制人或直接责任人仍需承担返还义务。若资金已转移或无法直接追回，医保部门可申请法院强制执行，通过查封、扣押财产等方式实现追偿。

2. 行政处罚的延续性
   机构注销不影响行政处罚的效力。根据《行政处罚法》第七十二条，若机构在注销前已收到行政处罚决定但未履行（如未缴纳罚款），行政机关可依法将处罚对象变更为其权利义务承继者（如股东、上级主管部门）或直接追究责任人个人责任。例如，若机构违规套取医保基金被罚款50万元，注销后仍需由相关责任人缴纳罚款，否则可能面临限制高消费、列入失信名单等措施。

3. 刑事责任的追究
   若违规行为涉嫌犯罪（如诈骗医保基金），公安机关可依法对机构直接负责的主管人员和其他直接责任人立案侦查。根据《刑法》第二百六十六条，诈骗公私财物数额较大的，可处三年以下有期徒刑；数额巨大或有其他严重情节的，最高可处无期徒刑。即使机构已注销，刑事责任仍会追究至个人，且违法所得需依法追缴或责令退赔。

4. 特殊情形处理

   • 资金用途合法化：若违规资金已用于合法支出（如支付员工工资、采购设备），需提供完整财务凭证证明资金流向，但仍需返还违规部分，合法支出部分可通过法律程序主张权益。
     
   • 机构合并/分立：若机构注销前与其他主体合并或分立，违规资金责任由承继其权利义务的主体承担，需通过工商登记、合同协议等证据确定责任主体。
     
   • 破产清算程序：若机构进入破产程序，违规资金追回应纳入破产债权申报，但因违法性可能被认定为“劣后债权”，优先清偿职工工资、税费等合法债务后剩余部分再予分配。

建议：若涉及具体案件，需尽快整理违规资金明细、机构注销文件、财务凭证等证据，向当地医保部门或公安机关报案，并咨询律师制定追偿或辩护策略。如有进一步疑问，可直接向我提问，我会结合具体案情提供法律分析。