结论：个人申请商标时，代理商要求申请一个个体工商户是否合法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从多个角度进行分析：
代理商的动机与合法性基础
- 合法动机：代理商可能建议申请个体工商户，是因为商标注册需要明确的主体身份。个体工商户作为一种经营主体形式，具有独立的法律地位，能够作为商标注册的申请人。如果个人希望以更规范、更易于管理的方式申请商标，且符合个体工商户的注册条件，那么代理商的建议可能是出于合法且合理的考虑。
- 非法动机：然而，如果代理商的目的是通过诱导个人申请个体工商户来获取不正当利益，如收取高额代理费、利用个体工商户进行非法活动等，那么这种行为显然是不合法的。
个体工商户注册的合法性要求
- 注册条件：根据相关法律法规，申请个体工商户注册需要满足一定的条件，如具备独立的经营场所、有合法的经营资格等。如果个人符合这些条件，且自愿申请个体工商户，那么这一行为是合法的。
- 注册程序：个体工商户的注册程序需遵循相关法律法规的规定，包括提交必要的申请材料、接受工商行政管理部门的审核等。如果代理商在协助个人申请个体工商户时，遵循了这些程序，且没有隐瞒或虚构事实，那么其行为也是合法的。
商标注册与个体工商户的关系
- 商标注册主体：商标注册的申请人可以是个人、企业或其他组织。个体工商户作为一种经营主体形式，同样可以作为商标注册的申请人。因此，从商标注册的角度来看，个人申请个体工商户并不违反法律规定。
- 商标使用与保护：无论商标注册申请人是个体工商户还是个人，都需要遵守商标法的相关规定，正确使用商标并保护其合法权益。如果代理商在协助个人申请商标时，提供了关于商标使用与保护的合法建议，那么其行为是值得肯定的。
潜在的法律风险与防范
- 法律风险：如果代理商在协助个人申请个体工商户或商标时，存在违法行为或不当行为，如虚假宣传、欺诈等，那么个人可能面临法律风险，如商标被撤销、承担法律责任等。
- 防范措施：为了防范这些法律风险，个人在选择代理商时应谨慎选择，了解代理商的资质和信誉情况。同时，在申请个体工商户和商标时，应仔细阅读相关法律法规和合同条款，确保自己的权益得到保障。
建议：
- 如果您希望申请商标，且代理商建议您申请个体工商户，请先了解代理商的动机和资质情况。
- 在申请个体工商户和商标前，请仔细阅读相关法律法规和合同条款，确保自己符合注册条件并了解相关权利和义务。
- 如有任何疑问或担忧，请及时向我咨询，我将为您提供专业的法律意见和帮助。