核心结论：若注册资本金被错误备注成借款，需根据实际情况采取不同措施来纠正和应对，主要可从账务调整、法律文件修正、与相关方沟通协商这几个角度处理。以下是详细说明：

1. 账务调整
   • 内部账务处理：如果公司财务在记账时将注册资本金误记为借款，首先应在公司内部财务系统中进行更正。这需要财务人员按照正确的会计科目和记账规则，将该笔款项从“借款”科目调整至“实收资本”科目。例如，原本借方记“银行存款”，贷方错误地记了“其他应付款 - 借款”，现在应将贷方改为“实收资本”。同时，要附上详细的调整说明，注明调整的原因、依据以及调整前后的账务情况，以便后续审计和查询。
   • 审计与税务处理：完成内部账务调整后，要关注审计和税务方面的影响。在审计时，向审计人员如实说明情况，提供调整的凭证和说明，确保审计工作的顺利进行。对于税务方面，虽然注册资本金的到账本身一般不直接涉及税费问题，但如果错误备注为借款可能会影响税务机关对公司财务状况的判断。例如，若被误认为借款利息支出，可能会涉及企业所得税等相关税费的计算。因此，要及时与税务机关沟通，说明情况，避免产生不必要的税务风险。
2. 法律文件修正
   • 公司章程修正：注册资本金是公司章程中的重要内容，若被错误备注为借款，可能需要对公司章程中关于注册资本的相关条款进行修正。召开股东会或股东大会，按照公司章程规定的程序进行表决，通过修正公司章程的决议。然后，根据工商行政管理部门的要求，准备相关的修正文件，如股东会决议、章程修正案等，前往工商部门办理章程变更登记手续，确保公司章程与实际的注册资本情况相符。
   • 出资协议修正（如有）：如果公司有出资协议，且出资协议中涉及注册资本的记载，也需要对出资协议进行相应的修正。与各出资方协商一致，签订出资协议修正案，明确注册资本的正确情况和各方的权利义务。修正后的出资协议应妥善保存，作为公司重要的法律文件之一。
3. 与相关方沟通协商
   • 与股东沟通：及时将注册资本金被错误备注为借款的情况告知股东，向他们解释错误产生的原因、可能带来的影响以及已经采取或计划采取的纠正措施。听取股东的意见和建议，确保股东对公司的财务状况和法律合规情况有清晰的了解，维护股东的合法权益。
   • 与债权人沟通（如有）：如果该错误备注可能会对公司的债权人产生影响，例如债权人基于错误的借款信息对公司提出了债权主张，公司应及时与债权人沟通，说明实际情况，提供相关的证明材料，如账务调整凭证、公司章程修正文件等，避免因误解而产生不必要的纠纷。

在处理注册资本金被错误备注成借款的问题时，要确保整个过程的合法性和合规性，保留好相关的证据和文件。如果对具体的处理方式存在疑问或遇到困难，可以随时向我咨询，我会为你提供更详细的法律指导。