刑事案件中的程序违法主要包括以下几种情形：
立案阶段的程序违法
- 应当立案而不立案：根据《刑事诉讼法》及相关规定，公安机关、人民检察院对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案。若应当立案而不立案，即构成程序违法。
- 不应当立案而立案：同样，若没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的时候，不予立案。若不应当立案而立案，也属于程序违法。
侦查阶段的程序违法
- 非法取证：包括刑讯逼供、威胁、引诱、欺骗等非法方法收集证据，以及违反法定程序收集物证、书证等。非法取证不仅违反了法律程序，还可能影响证据的真实性和合法性，从而影响案件的公正处理。
- 超期羁押：根据法律规定，犯罪嫌疑人、被告人在侦查阶段、审查起诉阶段和审判阶段的羁押期限都有明确规定。若超过法定羁押期限而未依法办理延长手续或释放犯罪嫌疑人、被告人，即构成超期羁押，属于程序违法。
- 违反回避制度：侦查人员、检察人员、审判人员等与案件有利害关系或其他可能影响公正处理案件的关系时，应当回避而未回避的，也构成程序违法。
审查起诉阶段的程序违法
- 应当起诉而不起诉：人民检察院认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定。若应当起诉而不起诉，即构成程序违法。
- 不应当起诉而起诉：同样，若犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。若不应当起诉而起诉，也属于程序违法。
- 违反审查起诉期限：人民检察院审查起诉的案件，改变管辖的，从改变后的人民检察院收到案件之日起计算审查起诉期限。若超过法定审查起诉期限而未依法作出起诉或不起诉决定的，即构成程序违法。
审判阶段的程序违法
- 违反公开审判原则：除涉及国家秘密、个人隐私和未成年人犯罪的案件外，人民法院审理案件应当公开进行。若违反公开审判原则，如未经批准不公开审理案件，即构成程序违法。
- 违反审判组织规定：人民法院审理案件应当由合议庭或独任审判员进行。若违反审判组织规定，如应当组成合议庭审理而独任审理，或合议庭组成不符合法定要求等，也属于程序违法。
- 违反审判程序：包括违反法庭调查、法庭辩论、被告人最后陈述等审判程序的规定，以及违反判决、裁定等法律文书的制作和送达程序等。这些程序违法都可能影响案件的公正处理。
程序违法的法律后果：
程序违法可能导致案件被撤销、改判或发回重审等后果。具体来说，若一审程序违法，二审法院可能撤销原判、发回重审；若二审程序违法，可能导致再审程序的启动。此外，程序违法还可能影响证据的采信和案件的定性，从而对被告人的权益产生重大影响。
建议：
在刑事案件中，程序合法性至关重要。若您或您身边的人涉及刑事案件，发现存在程序违法的情况，应及时向相关部门反映并寻求法律帮助。作为专业律师，我将根据您的具体情况，提供全面的法律分析和专业的辩护策略，以维护您的合法权益。