在自建房与包工头签订合同并希望有见证人签字的情况下，您可以遵循以下步骤和要点来确保合同的合法性和有效性：
一、合同准备阶段
明确合同内容：
- 详细列出施工的具体内容，如房屋主体建造、门窗安装、装修、屋面防水、电气照明工程等。
- 明确承包方式，是包工不包料还是包工包料，并详细列出各自的责任和义务。
- 约定工期、工程质量要求、付款方式等关键条款。
选择见证人：
- 见证人应是与双方无直接利害关系的第三方，如村里的长辈、邻居或村干部等。
- 见证人应具备完全民事行为能力，能够理解和判断合同内容。
二、合同签订阶段
双方签字：
- 确保发包方（甲方）和承包方（乙方）都在合同上签字或盖章，以表示对合同内容的认可和接受。
见证人签字：
- 在合同的重要部分或末尾，设置见证人签字栏。
- 见证人应仔细阅读合同内容，确认无误后在见证人栏签字或盖章，并注明签字日期。
- 见证人的签字是对合同签订过程的见证，有助于增强合同的证明力。
合同份数：
- 合同应至少一式三份，甲方、乙方和见证人各执一份，以便在需要时进行查阅和核对。
三、合同内容要点
详细施工内容：
- 明确列出每一项施工内容及其对应的价款，避免模糊不清或遗漏。
工程质量与验收：
- 约定工程质量标准和验收程序，确保施工符合规范要求。
- 重要施工过程应经甲方及邀请的乡镇负责安全管理人员验收后方能进行下一道工序。
付款方式与期限：
- 明确工程款的支付方式和期限，包括预付款、进度款和尾款等。
- 可以约定质量保证金，以确保施工质量的长期稳定性。
违约责任：
- 明确约定违约责任和违约金数额，以约束双方的行为并保障合同的履行。
- 违约金数额应合理，不能过高或过低，以免影响合同的公平性和有效性。
四、合同后续管理
合同存档：
- 合同签订后，应妥善保管合同原件，并备份复印件以备不时之需。
- 可以将合同复印件提交给乡（镇）人民政府存档，以便在需要时进行查阅和核实。
合同履行监督：
- 在施工过程中，甲方应定期对施工进度和质量进行检查和监督，确保乙方按照合同约定进行施工。
- 如发现乙方存在违约行为或施工质量问题，甲方应及时提出并要求乙方进行整改或承担相应的违约责任。
五、示例合同条款
以下是一个简单的合同条款示例，供您参考：
“本合同由甲方（发包方）与乙方（承包方）在平等、自愿的基础上签订，并由见证人XXX（姓名）见证签字。合同内容如下：
一、承包方式：包工包料。
二、施工内容：房屋主体建造、门窗安装、装修、屋面防水、电气照明工程等。
三、工期：自合同签订之日起XX天完成。
四、工程质量：符合国家相关标准和规范要求。
五、付款方式：分阶段支付，具体支付比例和期限见合同附件。
六、违约责任：如一方违约，应向另一方支付违约金XX元，并承担由此造成的损失。
七、本合同一式三份，甲方、乙方和见证人各执一份，具有同等法律效力。
甲方（签字/盖章）：_________
乙方（签字/盖章）：_________
见证人（签字/盖章）：_________
签订日期：__年月__日”
通过遵循以上步骤和要点，您可以确保自建房与包工头签订的合同具有合法性和有效性，并得到见证人的签字确认。这将有助于保障您的权益并避免潜在的纠纷。