关于您提出的“永久基本农田管理办法出台后原先的基本农田条例是否作废”的问题，这是一个涉及法律法规更新与替代的重要咨询。

首先，我们需要明确的是，永久基本农田管理办法的出台，并不意味着原先的基本农田条例就完全作废。实际上，随着国家对耕地保护重视程度的不断提升，相关法律法规也在不断完善和更新。在这个过程中，新的管理办法往往是在原有条例的基础上，结合当前的社会经济发展状况和耕地保护需求，进行修订、补充和完善而形成的。

具体来说，永久基本农田的概念是在原有基本农田的基础上，通过法律层面的确认和强化，体现了国家对耕地特别是基本农田的高度重视和严格保护的态度。2019年修正的《土地管理法》中，就将“基本农田”改称为“永久基本农田”，这一变更主要是为了强调其保护的永久性和特殊性。然而，这并不意味着原有的基本农田条例就失去了法律效力。在实际操作中，新的管理办法往往会明确指出其与原有条例的关系，以及哪些条款被保留、哪些被修改或废止。

此外，即使新的管理办法出台，对于之前已经按照原有条例进行划定、管理和保护的基本农田，其法律地位和保护措施通常也会得到延续和保障。除非新的管理办法中有特别规定，否则不会因为新法的出台而立即改变原有基本农田的管理状态。

因此，在永久基本农田管理办法出台后，原先的基本农田条例并不会完全作废。相反，两者可能会在一定时期内并存，共同构成耕地保护的法律体系。当然，随着时间的推移和法律法规的进一步完善，原有条例中可能不再适应当前需求的条款会逐渐被修改或废止，而新的管理办法中的相关规定则会得到更广泛的应用和执行。

总的来说，对于这类法律法规的更新与替代问题，我们需要关注新法的出台背景、目的和主要内容，同时也要了解新法与原有法规之间的关系和衔接方式。这样才能更准确地理解和把握新法的精神实质和实施要求。