农业设施建设用地是否可以改造，需视具体情况及是否符合法定程序而定，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
一、一般情况下的限制
农业设施建设用地，顾名思义，是主要用于农业生产相关设施建设的土地，如种植养殖配套的棚舍、仓库等。根据土地用途管制制度，这类土地直接转变为其他用途（如建设住宅、商业设施等）是受到严格限制的。这是为了保障农业生产的顺利进行，维护国家粮食安全和农产品供应，防止耕地面积减少，影响农业的可持续发展。
二、满足特定条件并可经法定程序改造的情况
尽管有上述限制，但在满足特定条件并经过法定程序后，农业设施建设用地仍有可能实现改造。这些条件包括但不限于：
符合规划调整与审批：
- 因经济社会发展需要调整土地用途时，必须首先对土地利用总体规划进行依法修改。例如，城镇化进程中需要在原农业设施用地上建设公共服务设施。
- 规划的调整需经过严格审批，由相关地方政府提出申请，经上级政府审查批准。涉及农用地转建设用地的，还需依照《土地管理法》等办理农用地转用审批手续。
符合政策与产业需求：
- 在农村产业融合发展的背景下，农业设施用地可用于与农业相关的加工、流通、休闲观光等产业建设，如乡村旅游中的游客接待中心、餐饮住宿设施。但这些建设须紧密围绕农业产业，且不对生态环境和农业生产造成严重影响。
- 对于农村电商、农产品冷链物流等新兴产业，在符合政策要求和产业发展规划的前提下，也可对农业设施用地进行合理调整。
依法办理手续：
- 用地单位或个人需向土地管理部门提出用地申请，并提交项目可行性研究报告、土地利用规划图、环境保护评估报告等材料。土地管理部门审核后，符合条件的报有批准权的人民政府批准。
- 按“占补平衡”原则，将农业设施用地改为其他用途的，需补充相应数量和质量的耕地，并缴纳耕地开垦费、新增建设用地土地有偿使用费等相关费用。
三、改造的具体操作流程
若你计划对农业设施建设用地进行改造，需遵循以下操作流程：
- 咨询相关事宜：向国土资源局、建设部门、规划部门咨询农用地转用的相关政策和要求。
- 提交用地申请：向建设部门提交用地申请，明确用地目的、位置、面积等信息。
- 用地预审：向同级国土资源局提出用地预审申请，对用地是否符合规划、政策等进行初步审查。
- 办理立项、规划等手续：向建设部门、环保局等办理项目立项、规划许可等手续。
- 正式用地申请：向国土资源局提出项目用地正式申请，提交完整的申请材料。
- 批准用地：国土资源局审核申请材料后，向用地单位发出批准用地文件。
四、注意事项与法律后果
- 禁止“以租代征”：严禁通过“以租代征”等方式使用农民集体所有农用地进行非农业建设，擅自扩大建设用地规模。
- 流转限定：农民集体所有建设用地使用权流转必须符合规划，并严格限定在依法取得的建设用地范围内。
- 违规后果：若未经批准擅自改变土地用途，将面临县级以上人民政府自然资源主管部门的责令改正、罚款，甚至刑事责任等法律后果。
总结与建议：农业设施建设用地的改造是一个复杂而严格的过程，必须遵循相关法律法规和政策要求。在计划改造前，建议你充分了解当地政策、咨询相关部门，并严格按照法定程序办理手续。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。