结论：将自有包装袋装别的品牌种子卖出，若销售金额达到五万元，可能涉及刑事责任，具体取决于是否构成假冒注册商标罪或销售假冒注册商标的商品罪等罪名。

分析：

1. 假冒注册商标罪：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百一十三条，未经注册商标所有人许可，在同一种商品、服务上使用与其注册商标相同的商标，情节严重的，构成假冒注册商标罪。
   • 应用分析：若你使用的包装袋上印有与别的品牌相同的注册商标，且未经该品牌所有者许可，同时销售金额达到五万元，这通常会被视为“情节严重”，从而可能构成假冒注册商标罪。

2. 销售假冒注册商标的商品罪：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百一十四条，销售明知是假冒注册商标的商品，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，构成销售假冒注册商标的商品罪。
   • 应用分析：如果你明知包装袋中的种子是假冒注册商标的商品，仍然进行销售，且销售金额达到五万元，这同样可能构成销售假冒注册商标的商品罪。

3. 其他可能涉及的罪名或情况：

   • 如果销售的种子本身存在质量问题，如属于劣质种子或假种子，还可能涉及生产、销售伪劣产品罪等其他罪名。
   • 如果销售行为还涉及其他违法活动，如欺诈、虚假宣传等，也可能同时构成其他犯罪。

法律建议：

• 立即停止销售行为：如果你正在或计划进行此类销售行为，应立即停止，以避免进一步的法律风险。
• 咨询专业律师：由于此类案件涉及复杂的法律问题和证据收集，建议你尽快咨询专业律师，以便更准确地评估你的法律风险和制定应对策略。
• 配合调查：如果相关部门已经介入调查，你应积极配合，如实说明情况，提供相关证据，以争取从轻或减轻处罚。

可能后果：

• 如果构成犯罪，你可能面临有期徒刑、拘役或罚金等刑事处罚。
• 除了刑事处罚外，你还可能面临民事赔偿、行政处罚等法律后果。

总结：将自有包装袋装别的品牌种子卖出，若销售金额达到五万元，且涉及假冒注册商标或销售假冒注册商标的商品等行为，可能构成刑事犯罪。因此，我建议你立即停止此类行为，并尽快咨询专业律师以评估你的法律风险和制定应对策略。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。