当您在前方遇到红灯，但交警示意您通行时，您应该优先服从交警的指挥通过路口。这是基于《中华人民共和国道路交通安全法》的明确规定，即在有交通警察现场指挥的情况下，车辆和行人必须按照交警的指挥通行。交警会根据实际的交通状况，如道路施工、突发事故等特殊情况，灵活调整交通秩序，以保障整体的交通安全和畅通。
关于是否会被扣分：
在此情况下，您按照交警的指挥通行，不会被判定为闯红灯，也不会因此受到处罚。交通管理部门的处罚是基于交通法规和实际情况的，而交警的现场指挥是具有法律效力的，因此您无需担心因此被扣分。
若因此被误罚，您应如何应对：
留存证据：为了确保自身权益，建议您在条件允许且不影响交通秩序的前提下，通过拍照、录像等方式记录下当时的场景。这包括交警的指挥动作、交通信号灯的状态以及周围的交通情况。这些证据在后续可能遇到的任何问题中都将起到关键作用。
申请行政复议：如果您因遵循交警指挥而在红灯时通行，却被交通管理部门错误地认定为交通违法行为并受到处罚，您可以在知道该具体行政行为之日起60日内，向作出处罚决定的上一级公安机关交通管理部门或者同级人民政府提出行政复议申请。在申请时，您需要提交相关证据材料，如现场照片、录像等，以证明自己是按照交警指挥通行的。复议机关将审查具体情况，并作出相应的复议决定。
提起行政诉讼：如果您对行政复议结果不满意，或者直接选择不进行行政复议，您还可以在知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内，向人民法院提起行政诉讼。法院将对案件进行全面审查，并根据法律和事实作出公正判决。
开具证明：另外，如果您因为服从交警的现场指挥而被拍照记录了闯红灯的行为，您可以到事发地的交警大队开具证明，证实当时是按照交警的指挥通行。这样，您即可免于处罚。
总结：
在遇到红灯但交警指挥让走的情况时，您应放心地按照交警的指挥通行，同时保持警觉，确保行车安全。若因此遭遇误罚，您可依据上述法律途径进行申诉，维护自己的合法权益。希望这些解答能够帮助到您，如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。