专项作业车超载的处罚主要依据超载比例及具体情节，通常包括罚款、扣分、暂扣或吊销驾驶证、扣留车辆等措施。以下是具体分析：

1. 罚款
   根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十二条，货运机动车超过核定载质量的，处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十或者违反规定载客的，处五百元以上二千元以下罚款。专项作业车虽不属于传统货运车辆，但若其设计用途包含载货功能（如起重车、清障车等），超载行为可能参照货运车辆标准处罚；若为纯作业型车辆（如高空作业车），则需结合地方性法规或具体执法口径判断。

2. 扣分
   依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶载货汽车载物超过最大允许总质量未达到百分之三十的，一次记1分；超过百分之三十以上未达到百分之五十的，一次记3分；超过百分之五十以上的，一次记6分。专项作业车若被认定为“载货汽车”范畴，则适用此规则；若被归类为“其他机动车”，则可能不扣分或适用其他条款。

3. 暂扣或吊销驾驶证
   若超载行为伴随其他严重违法情形（如无证驾驶、酒驾、事故逃逸等），可能面临驾驶证暂扣或吊销。例如，根据《道路交通安全法》第九十九条，将机动车交由未取得机动车驾驶证的人驾驶的，可吊销驾驶证；若超载导致重大交通事故，还可能构成交通肇事罪，面临刑事处罚。

4. 扣留车辆
   公安机关交通管理部门有权扣留超载车辆至违法状态消除。例如，要求卸载超载部分货物，或强制拖移至指定地点，相关费用由违法行为人承担。

特殊情形提示：

• 专项作业车的“核定载质量”可能因车型、用途不同而存在差异，需以行驶证标注为准。
  
• 部分地区可能对专项作业车超载制定更严格的地方性法规，建议结合当地政策进一步核实。
  
• 若超载行为涉及危险物品运输（如载有易燃易爆物品的专项作业车），处罚力度可能升级，甚至触犯《刑法》中危险驾驶罪条款。

如有具体案件细节（如超载比例、车辆类型、事故后果等），可进一步向我咨询，我会结合法律条文与实务经验为您详细分析。