核心结论：耕地种的农作物被他人毁坏，您可以通过协商、向相关部门投诉举报、提起民事诉讼或报警（若涉嫌犯罪）等方式来维护自身合法权益。以下是具体分析：
协商解决
- 尝试沟通：首先，您可以尝试与毁坏农作物的人进行友好协商，了解其毁坏农作物的原因，看是否能够通过和平的方式解决问题，比如要求对方赔偿损失、恢复耕地原状等。这种方式成本较低，且有助于维护邻里关系或商业合作关系（如果存在的话）。
- 达成协议：如果协商成功，双方可以签订一份书面协议，明确赔偿金额、赔偿方式、恢复耕地的时间等具体事项，以避免后续产生纠纷。
向相关部门投诉举报
- 农业农村部门：如果毁坏农作物的行为违反了农业管理方面的法律法规，您可以向当地的农业农村部门投诉举报。农业农村部门有权对破坏耕地、损害农作物等行为进行调查处理，并可以责令毁坏者停止违法行为、赔偿损失等。
- 自然资源部门：如果毁坏行为涉及到非法占用耕地、改变耕地用途等违反土地管理法律法规的情况，您可以向自然资源部门举报。自然资源部门会依法对违法行为进行查处，并可能对毁坏者处以罚款等行政处罚。
提起民事诉讼
- 确定被告：如果协商和投诉举报都无法解决问题，您可以考虑向法院提起民事诉讼。在诉讼中，您需要明确被告是谁，即毁坏农作物的人或单位。
- 收集证据：为了支持您的诉讼请求，您需要收集充分的证据来证明毁坏行为的存在、毁坏的程度以及您因此遭受的损失。证据可以包括现场照片、视频、证人证言、农作物价值评估报告等。
- 提起诉讼：准备好起诉状和相关证据后，您可以向有管辖权的法院提起诉讼，要求毁坏者赔偿您的损失，包括农作物的直接损失（如种植成本、预期收益等）以及因毁坏行为导致的其他间接损失（如恢复耕地的费用等）。
报警处理（若涉嫌犯罪）
- 判断是否犯罪：如果毁坏农作物的行为情节严重，涉嫌构成犯罪（如故意毁坏财物罪等），您应当立即向公安机关报警。公安机关会依法对案件进行调查取证，并追究毁坏者的刑事责任。
- 配合调查：在报警后，您需要积极配合公安机关的调查工作，提供相关证据和信息，以便公安机关能够尽快查明事实真相，维护您的合法权益。