针对您提出的问题，即“左转信号灯是红灯但是在专用调头车道绿灯时左转了该怎样处罚”，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

一、违规行为的判定

首先，我们需要明确的是，左转信号灯为红灯时，意味着在该方向上车辆是不允许左转的。即使专用调头车道显示绿灯，这仅允许车辆在该车道内进行调头操作，而并不意味着可以无视左转信号灯进行左转。因此，您所描述的行为，即左转信号灯为红灯时在专用调头车道左转，属于违反交通信号灯指示的严重交通违法行为，通常会被认定为闯红灯。

二、处罚措施

1. 罚款： 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，闯红灯的驾驶人将面临二十元以上二百元以下的罚款。具体罚款金额可能会因地区差异而有所不同，但通常都会在这个范围内。

2. 驾驶证记分： 根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶机动车不按交通信号灯指示通行的，一次记6分。这意味着，除了罚款之外，您的驾驶证还将被记6分。如果驾驶证记分累计达到12分，您将需要参加为期7天的道路交通安全法律、法规和相关知识学习，并通过考试才能恢复驾驶证的正常使用。

三、特殊情况说明

当然，也存在一些特殊情况可能不会被认定为闯红灯，例如：

• 交警指挥：如果现场有交警指挥，并且其指挥与交通信号灯不一致，那么应以交警的指挥为准。在这种情况下，左转不会被视为违法。

• 交通设施故障：如果因交通信号灯故障导致显示异常，并且您能提供相关证据（如行车记录仪视频）证明这一点，那么一般不会被认定为闯红灯。但即便如此，您仍需谨慎驾驶，注意观察周围交通情况，确保行车安全。

四、建议与总结

为了避免此类交通违规行为的发生，我建议您：

• 严格遵守交通信号灯指示，确保行车安全。
• 在行驶过程中，注意观察路面标志和交通信号灯的变化，及时调整行驶方向和车道。
• 如果不慎违反了交通法规，应主动接受处罚，并以此为鉴，避免再次发生类似行为。

综上所述，左转信号灯是红灯但是在专用调头车道绿灯时左转了，通常会被认定为闯红灯，并面临罚款和驾驶证记分的处罚。因此，请务必遵守交通法规，确保行车安全。