民办非企业单位章程的修改与理事变更之间确实存在一定的关联，但章程修改并不直接等同于理事变更，不过理事变更往往需要伴随着章程中相关部分的修订。以下是对这一问题的详细解答：

一、章程修改与理事变更的关系

1. 章程修改：民办非企业单位的章程是其组织活动的根本准则，修改章程通常涉及单位宗旨、业务范围、组织机构、管理制度等重大事项的变更。理事变更，作为组织机构变动的一部分，如果原章程中未明确规定理事变更的具体程序或条件，或者变更后的理事情况与原章程不符，那么就需要对章程进行相应修改。

2. 理事变更：理事是民办非企业单位决策机构的重要组成部分，其变更通常涉及理事的增补、替换或免职等。这种变更可能由于多种原因引起，如理事个人原因、单位发展需要或法律法规要求等。理事变更本身并不直接等同于章程修改，但它是触发章程修改可能性的一个重要因素。

二、理事变更时章程修改的必要性

1. 保持章程与实际情况一致：当理事发生变更时，为了确保章程的准确性和有效性，需要对章程中关于理事会组成、理事产生方式、理事职责等部分进行相应修订，以反映新的理事情况。

2. 满足法律法规要求：根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》等相关法律法规的规定，民办非企业单位在发生组织机构变动时，可能需要向登记机关提交章程修订案以进行备案或审批。因此，理事变更时修改章程也是满足法律法规要求的必要步骤。

三、理事变更及章程修改的程序

1. 内部决策：首先，由现任理事会召集会议，讨论并表决理事变更及章程修改事项。会议需有三分之二以上理事出席，决议须经全体理事过半数通过。

2. 准备材料：包括变更申请书、理事会决议、新理事的相关材料（身份证明、简历等）、章程修订案（明确修改内容）及其他可能需要的材料。

3. 业务主管单位初审（如适用）：在正式向登记机关提交变更申请前，需先向业务主管单位提交变更申请及相关材料，获得其同意变更的文件或签署意见。

4. 提交审批与审查：向登记机关提交变更登记申请及所有相关材料，等待登记机关的受理与审核。

5. 核准及发证：经审查核实后，若变更申请符合相关法律法规及政策要求，登记机关将作出准予变更登记的书面决定，并颁发新的民办非企业单位登记证书。

6. 公告与备案：核准变更登记后，登记机关将公告变更信息，同时民非企业也应在单位内部公示理事变更及章程修改情况，并将相关材料整理归档以备查阅和审计。

四、注意事项

• 在整个变更过程中，应严格遵守相关法律法规的规定，确保变更的合法性与合规性。
• 不同地区的具体办理流程和所需材料可能有所不同，建议在实际操作前咨询当地登记机关或专业律师以获取准确信息。
• 理事变更及章程修改是民办非企业单位发展中的重要事项，应谨慎对待并确保所有相关人员的知情权与参与权。