结论：合同签好后甲方在合同上补充条款并拍照通过微信上传，在经乙方同意的情况下，该补充条款一般是有效的，但需注意其作为证据的证明力及可能存在的风险。以下从多个角度进行分析：

一、合同补充条款的效力

1. 合同变更与补充：根据法律规定，合同双方可以在协商一致的基础上对合同进行变更或补充。甲方在合同上补充条款，并经乙方同意，这实际上是对原合同的变更或补充，只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，该补充条款即具有法律效力。

2. 形式要求：虽然补充条款是通过拍照并微信上传的方式呈现，但只要乙方明确表示同意，且该同意可以通过微信聊天记录等证据予以证明，那么这种形式并不影响补充条款的效力。因为法律并未规定合同变更或补充必须采用书面形式，只要双方能够达成合意即可。

二、证据效力与风险

1. 拍照件的证据地位：拍照件作为电子数据，属于法定证据种类之一。然而，在涉及合同纠纷时，拍照件的证明力相对较弱，因为其存在被篡改、伪造的可能性。因此，在后续可能发生的纠纷中，甲方需要提供其他证据来佐证拍照件的真实性，如微信聊天记录、电子邮件往来等。

2. 增强证明力的方法：为了增强拍照件的证明力，甲方可以采取以下措施：

   • 保存完整的微信聊天记录，包括乙方对补充条款的同意表示；
   • 如果可能的话，让乙方在补充条款上签字或盖章，并保留原件；
   • 结合其他证据，如交易凭证、履行情况等，形成完整的证据链。

三、特殊情况下的处理

1. 乙方未明确同意：如果甲方在补充条款后拍照上传，但乙方并未明确表示同意，那么该补充条款对乙方不具有约束力。因为合同的变更或补充需要双方协商一致，单方面变更或补充是无效的。

2. 更正式的确认方式：为了避免可能的纠纷和风险，建议甲方在补充条款后，与乙方通过更正式的方式（如书面确认、电子邮件等）进行确认。这样不仅可以确保补充条款的效力，还能提高其在后续纠纷中的证明力。

四、法律建议

1. 保留证据：甲方应妥善保存与补充条款相关的所有证据，包括微信聊天记录、拍照件、电子邮件往来等。这些证据在后续可能发生的纠纷中将起到至关重要的作用。

2. 及时确认：在补充条款后，甲方应及时与乙方进行确认，确保乙方对补充条款的内容无异议。如果可能的话，最好让乙方在补充条款上签字或盖章，并保留原件。

3. 咨询专业律师：如果甲方对补充条款的效力或证据效力存在疑虑，可以及时向我咨询。作为专业律师，我可以根据具体情况提供针对性的法律建议和帮助。

最后，合同签好后甲方在合同上补充条款并拍照通过微信上传，在经乙方同意的情况下一般是有效的。但为了确保补充条款的效力和证据效力，甲方应采取必要的措施来增强证明力并避免可能的风险。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。