结论：减资后资金不退还股东而转为借款，这一行为在法律上并非绝对禁止，但其合法性取决于多个因素，包括公司章程、股东会决议、借款协议的具体内容以及是否符合相关法律法规的规定。
分析角度一：公司章程与股东会决议
公司章程的约定：首先，需要查看公司章程中是否有关于减资后资金处理的具体规定。如果公司章程明确规定了减资后资金应如何处理，包括是否可以转为借款等，那么应当遵循公司章程的约定。
股东会决议：即使公司章程没有明确规定，减资及资金处理方案也需要经过股东会的决议通过。股东会作为公司的最高权力机构，其决议对于公司及股东均具有约束力。因此，如果股东会决议同意将减资后的资金转为借款，那么这一行为在内部程序上是合法的。
分析角度二：借款协议的合法性
协议内容：将减资后的资金转为借款，需要签订借款协议。借款协议应当明确借款金额、借款期限、利率、还款方式等关键条款。这些条款应当符合法律法规的规定，不得存在违法情形，如高利贷等。
双方意思表示真实：借款协议的签订应当基于双方真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。如果借款协议是在一方不知情或被迫的情况下签订的，那么该协议可能无效。
分析角度三：法律法规的遵守
公司法规定：根据《公司法》的相关规定，公司减资需要履行一定的程序，包括编制资产负债表及财产清单、通知债权人并公告等。如果减资程序不合法，可能会影响后续资金处理的合法性。
税法规定：将减资后的资金转为借款，还可能涉及税法的问题。例如，如果借款被视为公司对股东的分红或利润分配，那么可能需要缴纳相应的税款。因此，在操作过程中需要咨询专业的税务顾问，确保符合税法的规定。
法律建议：
完善内部程序：在决定将减资后的资金转为借款前，应确保公司章程和股东会决议对此有明确规定或同意。
签订合法借款协议：借款协议应当明确、合法，并符合双方的真实意思表示。必要时，可以请专业律师起草或审核借款协议。
咨询税务顾问：在操作过程中，应咨询专业的税务顾问，确保符合税法的规定，避免不必要的税务风险。
关注债权人利益：减资及资金处理方案应充分考虑债权人的利益，确保不会损害债权人的合法权益。否则，可能会面临债权人的法律诉讼或追偿。
可能后果：
如果未经合法程序或违反法律法规的规定将减资后的资金转为借款，可能会面临以下后果：
内部纠纷：股东之间可能因资金处理方案产生纠纷，影响公司的正常运营。
外部诉讼：债权人可能因公司减资及资金处理方案损害其利益而提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
行政处罚：如果违反相关法律法规的规定，公司及相关责任人员可能面临行政处罚，如罚款、吊销营业执照等。
因此，在决定将减资后的资金转为借款前，应充分考虑各种因素，确保操作的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。