您好，针对您提出的“男性监护人与女被监护人发生关系是否有罪”的问题，这是一个涉及法律与道德双重层面的严肃议题。

首先，从法律角度来看，如果男性监护人与已满十四周岁但不满十六周岁的女被监护人发生性关系，且该男性监护人利用其特殊职责或优势地位，或者采用暴力、胁迫等手段，那么这种行为是构成犯罪的。具体来说，根据《中华人民共和国刑法》以及《最高人民法院、最高人民检察院关于办理强奸、猥亵未成年人刑事案件适用法律若干问题的解释》的相关规定，负有特殊职责的人员（如监护人、收养人、看护人、教育者、医疗人员等）与已满十四周岁不满十六周岁的未成年女性发生性关系，若存在利用优势地位、迫使被害人与其发生性关系，或者具有其他恶劣情节（如长期发生性关系、致使被害人感染严重性病等），将依法以强奸罪或负有照护职责人员性侵罪定罪处罚。

其次，从道德层面来讲，监护人本应承担起保护被监护人、促进其健康成长的法律责任与道德义务。任何形式的性侵犯行为都是对被监护人身心健康的极大伤害，也是对社会公序良俗的严重违背。

以您提供的案例中的秦某为例，他作为小彤的继父，本应给予她关爱与保护，却利用监护关系形成的优势地位，多次与小彤发生性关系，这种行为不仅严重违背了监护人的职责，也触犯了法律。最终，秦某因涉嫌强奸罪、负有照护职责人员性侵罪被法院数罪并罚，判处了有期徒刑，这是对其犯罪行为的应有惩罚。

因此，男性监护人与女被监护人发生关系，在特定情况下（如利用特殊职责或优势地位、采用暴力胁迫手段等）是构成犯罪的。我们应当坚决反对并谴责任何形式的性侵犯行为，保护未成年人的合法权益与身心健康。如果您或身边的人遇到了类似的情况，请立即向公安机关报案，并寻求法律援助与保护。