公司高管违反操作规定造成严重损失的，其赔偿问题需结合具体情况，从民事赔偿、公司内部追责及可能的刑事责任三个角度综合分析，具体如下：

1. 民事赔偿角度
   根据《民法典》第1165条，高管因故意或重大过失违反操作规定导致公司损失，需承担赔偿责任。赔偿范围以实际损失为限，包括直接损失（如财产毁损、合同违约赔偿）和可预见的间接损失（如停业损失、商誉损害）。

   • 关键点：公司需证明高管行为与损失存在直接因果关系，且高管存在过错（故意或重大过失）。例如，高管未按流程审批重大投资导致资金损失，或违规操作导致生产事故。
     
   • 例外情形：若高管行为属于职务行为且无重大过错，或损失由市场风险等不可抗力导致，可能减轻或免除赔偿责任。

2. 公司内部追责角度
   公司可通过内部制度（如《员工手册》《高管责任制度》）或章程约定追责方式，常见包括：

   • 扣减奖金/绩效：根据损失比例扣除高管部分或全部奖金；
     
   • 追偿权行使：通过股东会决议要求高管赔偿，或直接提起民事诉讼；
     
   • 解聘：依据《公司法》第146条，高管违反忠实义务或造成重大损失的，公司可解除其职务。
     
   • 关键点：内部制度需经民主程序制定并公示，否则可能因程序瑕疵导致追责无效。

3. 刑事责任角度（若涉嫌犯罪）
   若高管行为触犯刑法，可能承担刑事责任，同时需承担民事赔偿：

   • 常见罪名：
     
     • 背信损害上市公司利益罪（《刑法》第169条之一）：上市公司高管违背忠实义务，致使公司损失重大；
       
     • 国有公司人员失职罪/滥用职权罪（《刑法》第168条）：国有公司高管严重不负责任或滥用职权，造成国有公司破产或严重损失；
       
     • 签订、履行合同失职被骗罪（《刑法》第167条）：高管在签订、履行合同过程中因严重过失被骗，致使国家利益重大损失。
       
   • 关键点：刑事责任需以“严重后果”为前提，且需证明高管主观上存在过失或故意。

建议行动步骤：

1. 固定证据：收集操作规定、损失证明、高管行为记录（如邮件、会议纪要）；
   
2. 内部追责：依据公司制度启动追偿程序，必要时通过股东会决议；
   
3. 法律程序：若内部追偿无果，可向法院提起民事诉讼；若涉嫌犯罪，向公安机关报案；
   
4. 风险防范：完善公司合规制度，明确高管职责边界，定期进行法律培训。
   

如有进一步细节（如损失金额、高管行为性质、公司类型等），可向我补充说明，以便更精准分析。